《口袋妖怪：漆黑的魅影》5.0版本中，一上來就是小田卷博士與我們對話，根據引導設定好自己的性別以及名字，然後劇情是玩家扮演的主角陷入了莫名的沉睡，目前是在進行引導主角醒過來的實驗中。具體劇情流程如下所示。
漆黑的魅影5.0攻略
在小田卷博士的引導下正式開始黑魅之旅
選好性別、名字
首發場景是小田卷的研究所，主角和女主都陷入了不明原因的沉睡
阿克羅瑪說要用奇怪的裝置引導主角清醒過來
漆黑創世傳說，包含了一二三周目地區的預告
然後是主角的夢境里，選擇最上方的紅色大門，其他兩個進不去
回到了卡車內，這是主角來到芳緣的第一天
下車，媽媽來打招呼，然後是上樓，調時間
調好後媽媽會過來對話，可以從電腦里拿出一個傷藥
依然看不到爸爸的鏡頭，媽媽說要你去找小田卷博士
博士不在家，先去拜訪一下鄰居(未白鎮平面地圖)
去二樓調戲下小遙，就出門吧
向上走，發現小田卷博士再次被追了(為什麼說再次呢==)
選初始精靈吧(小夜選了傲嬌蛇)
初始精靈：暖暖豬，技能：撞擊+叫聲
球海獺，技能：撞擊+搖尾巴
藤葉蛇，技能：撞擊+瞪眼
對方是Lv.2蛇紋熊，輕松搞定
回到研究所里，從博士那里拿到精靈後答應去找小遙
向上穿過101號道路(101號路平面地圖)
來到古辰鎮(古辰鎮地圖)
在店員那里拿到一個傷藥
繼續向上，在幻影之森找到索羅亞變成的小遙
被識破後進入戰鬥，Lv.5索羅亞
戰鬥勝利後得到Lv.5索羅亞
小遙表示要跟主角在103號道路比試(103號路平面地圖)
在下方路口找到小遙，對話進入戰鬥，小遙精靈：Lv.5火雉雞
勝利後得到小遙的半個愛心球(定情信物吧~)
原路回到研究所，得到精靈圖鑒和精靈球*5
出門媽媽給了風速鞋，按B鍵，模擬器X鍵可以跑步
出門向上走，在未白鎮上方草地可捕捉草系御三家
古辰鎮上方是水系御三家
古辰鎮左邊是火系御三家
在102號道路(102號道路平面地圖)
打敗幾個訓練師，在路口被叫住了，竟然是火箭隊
火箭隊的目標當然是主角手上的精靈了，進入戰鬥
火箭隊精靈：Lv.5喵喵
勝利後火箭隊跑掉了，而此時在研究所內，阿克羅瑪發覺有些不對勁
繼續向左，來到橙華市(橙華市地圖)
先去道觀看看吧
與爸爸對話後，與小光一起去抓精靈，此後略去無數字
與亞希達相遇(之後就不提這時不時出現的醬油君了)
繼續向左上，來到橙華森林(橙華森林地圖)
老地方又跟大叔見面了
水艦隊參上，進入戰鬥，對方為：Lv.9土狼犬
勝利後得到超級球
走出森林來到104號道路(104號道路地圖)
在花店里得到吼吼鯨噴壺和甜桃
到達卡那茲市(卡那茲市及道館地圖)
這里拿到HM01居合斬
在訓練師學校得到先制之爪
第一個道館為岩石系(卡那茲市及道館地圖)
館主精靈：Lv.15大岩蛇Lv.15鋼磁鼻Lv.18由基拉
勝利後得到岩石徽章和TM39岩石封
出門發現水艦隊搶走了大叔的包裹，幫忙找回來
沿著116號道路向右走(116號道路地圖)
在洞口看到哈奇老人，得知老人的精靈被搶走了
進洞，找到水艦隊的小兵，上前對話進入戰鬥
水艦隊小兵精靈：Lv.11土狼犬
勝利後得到得文行李箱，並歸還哈奇老人精靈
將包裹還給大叔，得到超級球，並去見社長
從社長那里拿到了大吾的信和口袋領航員
出門後有個研究員追上來加了對戰尋呼功能，然後給社長打個電話
向下走在卡那茲市出口看見小遙，登陸電話後進行對戰
小遙精靈：Lv.13蓮葉童子Lv.15火雉雞
橙華森林砍掉小樹，這里得到奇跡種子(橙華森林地圖)
在海邊的小屋找到哈奇坐船去武鬥鎮(武鬥鎮及道館地圖)
房子里得到盤絲頭巾
釣魚達人給了低級釣竿
第二個道館為格鬥系，附地圖一張
館主精靈：Lv.18腕力Lv.18里奧魯Lv.21幕下力士
勝利後得到拳擊徽章和TM08體格強化
向上來到石之洞窟，洞口的山男給了HM05閃光(石之洞窟地圖)(106號道路地圖)
洞里居然有不少火箭隊的小兵，二層的洞口在這里
二層最上方洞口進去可撿到神奇糖果和不變石
這里得到第二塊不變石
在洞窟最深處看到奇怪人物，上前對話並進入戰鬥
火箭隊幹部精靈：Lv.15超音蝠Lv.16瓦斯彈
勝利後洞里的火箭隊消失了，進洞發現大吾與一個人在對峙
那人自稱阿波羅，是火箭隊里頭領人物
上前交出信吧
得到了里奧魯的蛋，隕石碎片黃
插入一段現實的情況，火箭隊是不應該尋在過去的記憶中的
回到記憶中，先坐船回到橙華市，在社長那領學習裝置(橙華市地圖)
坐船去凱那市，在大海之家打敗三個訓練師可以得到蘇打水*6(凱那市及道館地圖)
原始之力的定點教學
房子里看親密的精靈可得到安閒鈴
虛張聲勢的定點教學
去造船廠這個npc對話激活後續劇情
來到博物館，買50元門票進去，門口的水艦隊小兵給了TM46
到二樓找到船長，水艦隊的人再次來搶奪，戰鬥
水艦隊小兵精靈：Lv.15利牙魚
Lv.14超音蝠Lv.14利牙魚
勝利後見到了水艦隊boss水梧桐
臨走前去商店買一個港口信紙
路口右轉向上，遇見小遙，對戰
小遙精靈：Lv.18長翅鷗Lv.20力壯雞Lv.18蓮帽小童
勝利後得到道具探測儀
向上走到達紫堇市，房子里得到HM06碎岩(紫堇市地圖)
這里用港口信紙交換硬幣盒
自行車店領一輛自行車
查看努力值的NPC
遊戲中心得到木守宮玩偶
道館門口跟小光對戰，對方精靈：Lv.16拉魯拉絲
勝利後小光回到綠蔭鎮
挑戰道館去吧，電系
館主精靈：Lv.21雷電球Lv.21皮卡丘Lv.23自爆磁怪Lv.24雷精靈
勝利後得到電力徽章、TM34電擊波
紫堇市右邊隱藏道具心靈鱗片
117號道路的培育屋，可生蛋(117號路地圖)
繼續向左到達綠蔭鎮，PC里定點學習連續切(綠蔭鎮地圖)
這里查看精靈親密度
進入最上方的隧道，用碎岩打碎擋路的岩石，得到HM04怪力
穿過隧道，在洞口的大叔那里得到重復球
回到紫堇市向上走111號道路，在連勝之家戰勝四個人得到競爭背心(111號路地圖)
繼續向上走，沙漠進不去，左轉112號道路(112號路地圖)
纜車被火岩團的人封鎖了，進入熱焰小徑(熱焰小徑地圖)
走出熱焰小徑，這里得到TM43秘密力量
這里可以恢復體力(111號路地圖)
向左來到113號道路，房子里拿到冰結晶收集袋，可以製作玻璃(113號路地圖)
在洞口看到米可利，上前對話後進入寒冰小徑(寒冰小徑地圖)
火箭隊擋在半路，對話進入戰鬥，開場白換了喲
火箭隊精靈：Lv.20阿柏蛇Lv.20瓦斯彈Lv.22喵喵
勝利後火箭隊跑掉，出洞來到蒼白之森(蒼白之森地圖)
再次遇到米可利，不過這次是火箭隊喬裝的，進入戰鬥
拉姆達精靈：Lv.24拉達Lv.24大嘴蝠Lv.26百變怪
勝利後繼續向前，在最深處看到米可利和雅典娜
雅典娜走後上前給米可利看到隕石碎片?黃，米可利便將隕石碎片?藍也交給了主角
轉回現實的事不多加論述了，繼續遊戲旅程
這只是一條線而已==，繼續向左走來到冬雪鎮(冬雪鎮地圖)
商店里有搖手指的定點教學
這里可以用心靈鱗片回憶技能
向左走，房子里得到TM28挖洞(114號路地圖)
這里得到TM05吼叫
114號道路的房子里得到炎帝玩偶
來到流星瀑布，得知火岩隊要在煙突山搞什麼陰謀
回到112號道路的纜車這里，對話去煙突山(112號路地圖)
火岩隊boss赤焰松精靈：Lv.24大狼犬Lv.25噴火駝Lv.24超音蝠
勝利後從裝置上取下隕石碎片?赤
離開的時候遇上了大吾，將碎片全部交給了他拿去綠嶺市研究
意外凸顯，大吾竟然是拉姆達扮裝的，而此時植入主角記憶的己方人格代碼終於出現了
對方自稱庫魯瑪，並幫助主角拿回了碎片
另一邊的現實中，阿克羅瑪也在分析火箭隊出現的原因
來到釜炎鎮，這里得到小果然的蛋(釜炎鎮及道館地圖)
這里是模仿的定點教學
中藥店里得到木炭
第四個道館為火系，附地圖及走法如下
火系館主精靈：Lv.24戴魯比Lv.26呆火駝Lv.24鴨嘴炎龍Lv.31煤炭龜
勝利後得到火焰徽章和TM50焚燒殆盡
出門小遙給了go-go護眼罩，沙漠可以進去了
回到熱焰小徑之前被石頭擋住的地方，用怪力推開石頭(熱焰小徑地圖)
走上方的洞口，在盡頭捕捉Lv.40炎帝(小夜為通關效率修改了大師球求諒解QAQ)
下方撿到火焰石
回到寒冰小徑，用怪力推開這里的石頭(寒冰小徑地圖)
盡頭捕捉Lv.40急凍鳥
然後去沙漠幻影塔，記得換上風馬自行車(幻影塔地圖走法)
只需要沖過第二層的斷層即可，大大降低了難度，在塔頂撿到化石，二選一，另一塊二周目可拿
從綠蔭鎮的隧道來到卡那茲市，在得文公司二樓復活化石(綠卡隧道地圖)
身上留個空位，再去找研究員即可
卡那茲市向下走回到橙華市，去挑戰爸爸的道館(橙華市及道館地圖)
道館做了簡化，只有兩名訓練師及館主
普通系道館，館主精靈：Lv.29卡比獸Lv.29吉利蛋Lv.31袋龍Lv.33請假王
勝利後得到天秤徽章和TM42假勇敢
小光的父親給了HM03沖浪
先回家一趟，拿到護身金幣(未白鎮地圖)
橙華市左邊向下，沖浪(108號路地圖)
武鬥鎮繼續向右，來到廢棄船(廢棄船攻略)
在研究員身邊撿到倉庫鑰匙
打開倉庫，得到TM35噴射火焰
回到紫堇市，與電系館主對話得到新紫堇的鑰匙(紫堇市地圖)
在這里沖浪向右走，來到新紫堇的洞口
對著門使用鑰匙，即可進入，在最深處踩紅色按鈕關掉發電機(新紫堇地圖)
這里是雷電石
這個路口進入，可捕捉Lv.40雷皇
回去向館主報告，得到TM24十萬伏特
紫堇市向右沖浪，河邊大叔給了中級釣竿
遇到大吾，對話之後就走了
樹果大師的花園，隨便摘
沿著119號道路向上走，來到天氣研究所，點床可以恢復體力(119號路地圖)
在二樓與水艦隊的首領對話進入戰鬥
水艦隊首領精靈：Lv.28利牙魚Lv.28大狼犬
勝利後得知火岩隊要在送神火山有所動作，水艦隊的人全部趕去了那里
研究員給了一隻精靈作為謝禮，Lv.25漂浮泡泡
從研究所出門過橋，小遙追上來要求對戰
小遙精靈：Lv.29大嘴鷗Lv.31力壯雞Lv.29蓮帽小童
勝利後得到HM02飛空
沿路走，來到茵郁市，這里是賣家具商店(茵郁市地圖)
這個房子里找老奶奶猜硬幣(小夜的順序為右右左)，得到TM10覺醒力量
老爺爺這里可學習夢話
道館被看不見的東西擋著，先向前走來到120號道路(120號路地圖)
在橋上見到大吾，對話進入戰鬥，Lv.30變隱龍
勝利後得到得文觀測鏡
在道觀門口使用觀測鏡，擋路的精靈跑掉了
可以挑戰道館了，飛行系(茵郁市飛行道館地圖)
館主精靈：Lv.31嘟嘟利Lv.31姆克鷹Lv.33盔甲鳥Lv.35七夕青鳥Lv.32暴鯉龍
勝利後得到白羽徽章和TM40燕返
茵郁市向右下沿路走，在路口看見三個水艦隊小兵
追著三人向下，使用沖浪來到送神火山(122號路地圖)
得到清符
塔頂的用途不明的墓碑
走一層的出口，撿到TM48特性交換
沿著路走，打倒路邊的水艦隊小兵
山頂遇到水梧桐，但是紅色玉石已經被搶走了，從老奶奶那里拿到火岩隊之證
在送神火山門口向下沖浪來到122號道路(122號路地圖)
身上攜帶草系精靈與之對話可得到TM19億萬噸吸收
回到之前的路口向右走，這里砍樹進去可以捕捉Lv.20閃光皮丘
繼續向右來到水靜市，PC里謎題的答案為冰系，獎勵神奇糖果(水靜市地圖)
華麗大賽的會場得到能量方塊盒，可以進入砂狐樂園了
這里拿到夢幻船票(二周目捉神獸用)
隱藏道具心靈鱗片
房子里得到TM44睡覺
遺忘老爺爺
與百貨大樓門口的小遙對話，進入對戰
小遙精靈：Lv.31熱帶龍Lv.32大嘴鷗Lv.34力壯雞Lv.32樂天河童
小遙要回未白鎮，主角繼續旅程
上方是魅影摩天樓，二周目開啟(摩天樓平面圖)
先去121號道路的砂狐樂園，門票500，帶上音速自行車
(121號路地圖)
(砂狐樂園地圖)
進門向左走，沖上一個斜坡
走到盡頭在湖中間可捕捉Lv.35閃光暴鯉龍(附近的草叢里有伊布，喜歡的不要錯過)
右上是TM22陽光烈焰
用飛空術飛到釜炎鎮，向右跳下去向上走，坐纜車來到煙突山，觸發劇情
(釜炎鎮地圖)
(煙突山地圖)
出現一個洞口，進入後發現是火岩隊的基地
在洞的盡頭目睹赤焰松喚醒古拉頓，藍光過後古拉頓不見了
之後進入與赤焰松的戰鬥
赤焰松精靈：Lv.37大狼犬Lv.38叉字蝠Lv.39噴火駝
勝利後赤焰松走了，主角接著去阻止水艦隊的計劃
用飛空術飛到凱那市，在港口圍觀采訪(凱那市地圖)
水艦隊的人搶走了潛水艇，返回了水靜市的基地(水靜市地圖)
直接飛空到水靜市，向右走，沖浪來到海上基地
關於水艦隊基地只說明從這里通向大師球所在地的走法(水艦隊基地地圖)
附圖如下，按序號走就好了
兩只Lv.30頑皮彈、金色珠、大師球
然後每次都走最右邊的圓盤即可到達劇情處
在盡頭有個炮灰來拖延時間，精靈為：Lv.34大狼犬Lv.34大嘴蝠
勝利後潛水艇已經走了
從水艦隊基地出門後向右沖浪，沿著124號道路來到綠嶺市
(124號路地圖)
(綠領市及道館地圖)
這里可以用碎片交換進化石
爆裂拳的定點學習
對話得到王者之證
得到高級釣竿
然後去挑戰道館，超能系
館主精靈：Lv.43天然鳥Lv.43青銅鍾Lv.44太陽岩Lv.44月石
勝利後得到心靈徽章和TM04冥想
出門向右走，發現火箭隊，追上去，門口得到太陽石
樓梯口再次見到火箭隊三人組，精靈為：Lv.33果然翁Lv.35喵喵Lv.33阿柏怪Lv.33雙彈瓦斯
勝利後繼續走，與大吾共同對付火箭隊的頭領
火箭隊精靈為：Lv.42雙彈瓦斯Lv.44黑魯加Lv.43叉字蝠
Lv.42阿柏怪Lv.44紳士鴉Lv.43霸王花
勝利後得知探測器還是被拿走了，應邀去找大吾
大吾的房子在這里，得到HM08潛水
從綠嶺市向下沖浪，在最大的深色水域潛水即可到達洞窟(水艦隊洞窟地圖)
找到水艦隊的潛水艇了，上浮到達水艦隊基地
在洞窟盡頭水梧桐趕來，對話後進入戰鬥
水梧桐精靈：Lv.41大狼犬Lv.41叉字蝠Lv.43巨牙鯊
海皇牙蘇醒後消失在洞內，世界大亂了
去找琉璃島吧，向左上沖浪，在白色石頭附近潛水下去找到城市入口
古拉頓和海皇牙在打架
PC內捨身的定點學習(硫磺島地圖)
在城市左邊找到大吾，與之對話，被帶到覺醒神殿找米可利
在深處找到米可利對話，選擇天空之柱
天空之柱在131號道路靠近暮水鎮的海域(131號路地圖)
米可利將門打開了，向上走，是將一切揭曉的時候了
火箭隊三人組出現，進入戰鬥(天空之柱地圖)
火箭隊精靈：Lv.42飯匙蛇Lv.45喵喵Lv.43阿柏怪Lv.43雙彈瓦斯Lv.42毒粉蝶Lv.43果然翁
另一邊，庫魯瑪遭到了火箭隊四名幹部的圍攻
在頂層遭遇了阪木和庫魯瑪，對話後上前與阪木戰鬥
阪木精靈：Lv.44袋龍Lv.50重甲暴龍Lv.46尼多王Lv.46尼多後Lv.46三地鼠Lv.44紳士鴉
勝利後庫魯瑪將阪木滅殺於系統中，並得到隕石碎片·綠
在現實世界中留下了一個懸念，估計要到二周目才能解開了
回到主角的回憶中，上前喚醒裂空座，將隕石碎片交給小遙
飛回琉璃島觀看裂空座解決爭端
沖浪到中間的小島，與兩位首領對話，然後從米可利處得到HM07登瀑術
挑戰道館吧，屬性為水系，冰面只能踩一次(精靈道館平面圖)
館主精靈：Lv.45乘龍Lv.47美納斯Lv.50刺龍王Lv.45暴鯉龍Lv.47樂天河童
勝利後得到雨滴徽章和TM03水之波動
===============至此全部8個徽章集齊================
從綠嶺市向下沖浪，由最下方的水道向右，來到大瀑布前面(綠嶺市地圖)
瀑布底部的洞穴內可捕捉Lv.40水君
用攀瀑登上去，進入冠軍之路(冠軍之路地圖)
過了橋小光追上來要求對戰
小光精靈：Lv.49七夕青鳥Lv.49火爆獸Lv.49巨龍花Lv.50沙奈朵Lv.49大力鱷
勝利後繼續向上走進洞
推開石頭後走下方需要碎岩的路，然後過橋向上走碎岩怪力後進洞(PS：這一層可遇到化石翼龍、卡比獸)
洞內是Lv.40火焰鳥
然後出洞，走下方的樓梯，在這里沖浪向左上走
使用攀瀑沿著水道進入這里的樓梯
第一個路口向下，用碎岩和怪力開路，沿路走到達精靈聯盟(彩幽市地圖)
~~~~~~寫在挑戰聯盟之前~~~~~
補充廢棄船部分，在有水的房間內潛下去
沿著路走，上浮來到有六個房間的船艙，只有這個房間能進去
在這里找到一號房間的鑰匙
打開一號房間的門，找到4號房間的鑰匙
在4號房間內找到6號房間的鑰匙
從6號房間向左走到5號房間，找到2號房間的鑰匙
最後在2號房間找到探測機
在二樓的船艙內與研究員對話，答應去交給館長
在凱那市的港口找到NPC，可以從深海之牙和深海之鱗中二選一(珍珠貝進化用)(凱那市地圖)
飛到冬雪鎮，向左下走來到流星瀑布，在這里沖浪並攀瀑，走左邊的樓梯
(冬雪鎮地圖)
(流星瀑布地圖)
沖浪向上走，進入洞穴，洞穴一層可遇到迷你龍
第二個洞內可捕捉Lv.40閃電鳥
綠蔭鎮左上的卡綠隧道，在這里沖浪，出去後使用攀瀑爬上去(卡綠隧道地圖)
來到這個洞里
左邊洞口可捕捉Lv.70鳳王
右邊的洞里是Lv.70洛奇亞
隱藏道具黑眼鏡
由暮水鎮向右，來到天空之柱，帶好音速自行車沖過斷層(天柱走法)
在頂層捕捉Lv.70裂空座
一周目神獸補充完畢，附總圖如下
然後去挑戰聯盟吧
四天王花月精靈：Lv.56紳士鴉Lv.58班吉拉Lv.56黑魯加Lv.55狡猾天狗Lv.56月精靈
四天王芙蓉精靈：Lv.57耿鬼Lv.58夜黑魔人Lv.59耿鬼Lv.57鬼盆栽Lv.56夢魘
四天王波妮精靈：Lv.59冰鬼護Lv.59猛獁豬Lv.58迷唇姐Lv.60乘龍Lv.58河馬王
四天王源治精靈：Lv.60快龍Lv.60化石翼龍Lv.59三頭龍Lv.59七夕青鳥Lv.61血翼飛龍
最後是冠軍米可利
米可利精靈：Lv.62刺龍王Lv.64美納斯Lv.61樂天河童Lv.61沼王Lv.62電燈怪Lv.61暴鯉龍
勝利後成為了新的冠軍，進入里面的房間登記精靈
然後可選擇跳過動畫，一周目達成
來源：3DMGAME
