Tag: 基因變異

據媒體報導，在一項迄今展開的規模最大的全基因組關聯研究中，研究人員已經編目了178個跟重度抑鬱症相關的基因變異。這項研究查看了數百萬人的健康記錄，希望藉此開發出一種能檢測出那些最容易患抑鬱症的人的基因測試。 資料圖 抑鬱症是一種高度復雜的疾病，沒有單一的成因。從社會、環境、心理條件到遺傳或生理因素，一系列的因素都可能導致抑鬱。 2019年的一項薈萃分析鎖定了約100個跟抑鬱症相關的基因變異。據估計，一個人患重度抑鬱症的風險中有40%是由遺傳基因變異引起的。 現在，由耶魯大學的一個團隊領導的一項研究擴大了風險因素的基因庫。研究分析了120萬名受試者的健康記錄，其中包括來自美國、英國和非洲的個人。該研究報告了178個跟重度抑鬱症(MDD)相關的遺傳變異。 下一步則是在一個單獨的隊列中重復這些發現。研究人員通過跟23andMe基因公司的合作對另外130萬人進行了研究，他們最終確認了這些基因標記確實跟抑鬱症有關。 「最令人振奮的是，我們可以在獨立的數據集中復制我們的發現，」耶魯大學精神病學系、這項新研究的論文共同主要作者Daniel Levey說道，「復制是良好科學的一個標志，這篇論文指出了GWAS（全基因組關聯）研究的結果是多麼得可靠和穩定。」 其中一些研究結果證實了先前關於抑鬱症遺傳起源的研究如證實了NEGR1基因的一種變體在重度抑鬱症中起作用。該基因以影響神經生長並在下丘腦高度表達為人們所知。DRD2--一種多巴胺受體基因--在新的研究中也被標記出來，其驗證了先前的研究，該研究將其跟抑鬱症和焦慮症的風險增加聯系在一起。 由於抑鬱症是一種非常復雜的疾病，因此永遠不會發現某個單一的基因是罪魁禍首。就像其他多基因條件一樣，每一個遺傳變異都只會給個體增加一點點額外的風險。 該研究的資深合著者Joel Gelernter預計，還將發現更多跟抑鬱症有關的基因變異。隨著科學家們建立起這一知識體系，他們最終將能開發出一種基因測試以將所有這些發現整理成一個多基因風險評分，這將幫助醫生確定哪些人最容易患上抑鬱症及其他精神疾病。 Gelernter補充道：「我們發現了如此多的變體，對此我們並不感到驚訝。我們不知道還有多少有待發現--幾百個？甚至數千個？」 來源：cnBeta

一項測試新型1型糖尿病疫苗的2期試驗結果發現，該療法對具有特定基因變異的患者亞組有效。如果在更大的試驗中得到驗證，這種新療法對大約50%的1型糖尿病患者有幫助。 幾年來，研究人員已經知道，1型糖尿病的關鍵指標之一是存在針對一種叫做GAD65的胰腺蛋白的自身抗體。在這些糖尿病患者中，這些自身抗體的存在往往是疾病的早期徵兆，研究人員早就假設了破壞這種自身免疫機制的可能性，以幫助防止胰島素生成細胞的破壞。 為了幫助免疫系統對這些天然的GAD蛋白有更強的耐受性，研究人員開發了一種名為GAD-alum的疫苗。如果新診斷的糖尿病患者的免疫系統可以被「訓練」成停止破壞GAD蛋白，那麼假設可以保留某種程度的天然胰島素生產。然而，最近幾年的一些GAD疫苗試驗沒有得出結論。 一項在100多名新診斷的年輕1型糖尿病患者中測試GAD疫苗的2期試驗背後的研究人員建議，一個特定的基因變體可能是了解這種治療方法可能對誰有效的關鍵。 109名患者中的一半人每月接受三次GAD-alum注射，而另一半人則接受安慰劑注射。15個月後，治療組和安慰劑組之間的胰島素分泌沒有整體差異。但是，研究人員確實在治療組中的一個具有特定基因變異的患者亞組中發現了明顯的積極效果。研究人員觀察了HLA基因的一個變體，即DR3-勇者鬥惡龍2，發現15個月後胰島素分泌有明顯的臨床保護作用。試驗中大約50%的患者都有這種特殊的遺傳變異。 瑞典林雪平大學從事這項研究的研究員Johnny Ludvigsson解釋說：「在HLA基因DR3-勇者鬥惡龍2類型的亞組中，患者並沒有像其他患者那樣迅速失去胰島素分泌。相比之下，我們在沒有這種HLA類型的患者中沒有看到任何明顯的影響。」 這項新的試驗發現可能有助於解釋先前GAD疫苗研究的不一致結果。Ludvigsson還指出，雖然這種積極的治療效果並不能完全拯救糖尿病患者的所有胰島素生成細胞，但它可以幫助身體保存一些小水平的胰島素生成，這對幫助維持安全的血糖水平有重要意義。 更大的試驗將需要驗證這些結果，但Ludvigsson說這種新的治療方法可能對大約50%的1型糖尿病患者有幫助。 Ludvigsson說：「用GAD-alum治療似乎是一種有希望的、簡單的和安全的方法，可以在大約一半的1型糖尿病患者中保持胰島素的分泌，這些患者擁有正確的HLA類型。這就是為什麼我們期待著開展更大規模的研究，我們希望這些研究將導致一種能夠改變1型糖尿病進展的藥物。」 這項新研究發表在《糖尿病護理》雜誌上。 來源：cnBeta

從廣島和長崎的兩顆原子彈，到上世紀六七十年代的數百項核試驗，到1986年的車諾比事件，再到福島核電站事故與核廢水排放。過去幾十年，當普通民眾談到核輻射，很自然就會心生恐懼，將它與基因變異聯系起來。今日，頂尖學術期刊《科學》在線發表了兩篇堪稱「里程碑」的論文，在車諾比事件的35年後，利用最新的基因測序工具，重新評估了核輻射對當地居民的影響。 第一項研究專注回答這樣一個問題：核輻射導致的基因變異，會不會遺傳給下一代。研究人員們尋找到了當年負責清理現場的工人，或是居住在事故地點附近的居民（可能攝入含有核污染的食物），對他們以及他們的後代做了全基因組的分析，尋找基因變異的影子。 本研究里，他們所尋找的是一種叫做「新生突變」（de novo mutation）的基因變異。這是一種出現在精子或者卵子中的基因變異，不存在於父母其他的細胞之中，卻可以傳遞給後代。 研究調查了130名出生於車諾比事件之後的人，其中有人在事件的46周後出生，有人在事件的15年後出生，有著廣泛的范圍。分析表明，與普通人群相比，他們體內的「新生突變」數量並沒有明顯變多。也就是說，該事件產生的電離輻射對下一代的健康影響微乎其微。 1996年時，車諾比附近的輻射劑量（圖片來源：CIA Factbook， Sting （vectorisation）， MTruch （English translation）， Makeemlighter （English translation）， CC BY-SA 2.5 ， via Wikimedia Commons） 「我們的這些結果可以讓2011年福島核電站事故發生時，居住在福島的人安心。日本的已知輻射劑量低於車諾比事件的輻射劑量。」 本研究的通訊作者之一Stephen J。 Chanock教授說道。 第二項研究中，科學家們則關注另一個問題——電離輻射對甲狀腺癌會產生怎樣的影響？因為在車諾比事件之後，人們已經確鑿觀測到這種癌症的風險有所上升。為此，研究人員們分析了359名曾暴露在輻射下的人的甲狀腺癌基因組。他們當時要麼還是兒童，要麼還在母親的腹中尚未出生。此外，研究人員還找了81名沒有暴露在輻射下的個體，將他們的甲狀腺癌基因組作為對照。 具體來看，研究人員們分析了這些腫瘤里的致癌基因變異。和過去的報導一樣，無論是輻射暴露組，還是對照組，許多調控細胞生長的基因都發生了變異。 但兩組的基因變異類型卻有明顯不同。小時候暴露在輻射下的人，關鍵基因更多出現「融合變異」。研究人員們說，這可能因為電離輻射帶有的能量，打斷了DNA雙鏈。當DNA雙鏈重新修復時，可能將錯誤的片段連接進來，產生變異。相反，對於那些沒有暴露在輻射下的個體，他們更多出現的是點突變。 不同劑量下，甲狀腺腫瘤中帶有的突變類型 而且研究人員們也觀察到，暴露於輻射時兒童的年紀越小，DNA雙鏈斷裂與輻射暴露之間的關聯就越強。這也表明DNA雙鏈斷裂可能是暴露於輻射後，最早出現的基因變異之一。這對輻射誘導的癌症的研究有著重要的啟示意義。 「該研究令人興奮的一點在於，我們有機會將腫瘤的基因組特徵與輻射劑量進行關聯，這正是可能導致癌症的潛在風險因子。」本研究的負責人之一Lindsay M。...

4月1日消息，不育問題影響了英國10%的男性，但其中60%男性不育病例的原因尚不明朗。現在科學家發現，Y染色體上的一種基因變異體會顯著增加男性面臨生殖問題的幾率。該變異體似乎會影響Y染色體上對精細胞發育至關重要的區域。 資料圖 研究人員希望對該基因變異體進行監測跟蹤，或許可以在某些男性成年早期確定具有較高不育風險的人群，從而幫助他們對未來的生育計劃做出更明智的決定。 在這項研究中，維康桑格研究所和塔爾圖大學的研究人員進行了一項迄今為止規模最大的基因研究，目的是為探究無法解釋的男性不育問題。 研究招募了2300多名愛沙尼亞男性，其中約有一半男性曾遭遇過無法解釋的不育問題。針對他們的基因組進行分析後，研究人員發現，其中有些男性的Y染色體上攜帶了一個基因變異體，在已知對精細胞發育（精子形成）至關重要的區域發生倒位。 雖然倒位本身似乎不會對生育能力造成直接影響，但卻會導致攜帶者的Y染色體上這一部分出現較高幾率的基因缺失。研究人員稱，該部分的基因缺失或可使精子減少、乃至無精子存在的風險提高九倍。 僅倒位這一現象就相對普遍，並且可以從父親遺傳給兒子。歐洲後代中有「相當多」男性Y染色體上有這種倒位。 塔爾圖大學、維康桑格研究所的資深研究科學家表示他們在對該特定染色體區域基因變異進行了規模最大、最復雜的研究，該區域的基因變異可能會增加男性精子形成功能受損的風險。 他們通過接觸大量的患者和有參考價值的男性，將他們的遺傳數據與男科信息進行比較，我們可以確定一種常見Y染色體亞型，這個Y染色體亞型容易受到導致精子數量減少的基因變化的影響，同時也不易被發現，從而遺傳給後代直至該基因組區域發生基因缺失。 研究團隊希望他們的發現可以促進這種Y染色體亞型、倒位和缺失的篩查，以幫助男性了解生殖問題的根源。 愛沙尼亞塔爾圖大學生物醫學與轉化醫學研究所的科學家們認為，找到男性精子生產功能受損的遺傳因素，將有助於他們的診斷並獲得相應的幫助。 他們表示雖然之前我們也知道Y染色體上的一些基因缺失會干擾精子生產，但細致到這樣一個層面上的了解對管理男性生殖問題十分重要。在這種情況下，男性可以選擇盡早生育後代或將精子保留以備後用，這些都是值得討論的方案。 在英國，據估計，每七對異性夫妻中間，就有一對受不孕不育問題的困擾。英國國民醫療服務體系解釋說：「導致不孕不育的可能原因有很多。夫妻雙方中的任何一方都有可能不孕不育。但是在25%的案例中，病因難以確定。」 來源：cnBeta

一項調查遺傳學、飲食和心髒健康之間關系的研究聲稱，通常與服用魚油補充劑有關的心血管益處可能只在具有某種基因的個體中才會顯現。該關聯研究表明，未來可能會通過考慮一個人獨特的基因構成來優化營養建議。 近年來，越來越多的研究開始質疑長期以來推薦omega-3魚油補充劑對心血管疾病高危人群有益的建議。幾項大規模的薈萃分析發現，服用這種流行的補充劑幾乎沒有好處，一項測試魚油中一種特殊脂肪酸的純化濃縮形式的3期臨床試驗在中期數據顯示沒有好處後被終止。 發表在《PLOS Genetics》雜誌上的一項新研究，着手調查一種新的基因-飲食相互作用是否可以解釋先前研究中明顯的不和諧。進行了一項全基因組關聯研究，涵蓋了超過7萬名英國生物庫參與者。研究中發現，一個影響一個名為GJB2的基因的特定基因變異，與那些服用魚油補充劑的受試者的甘油三酯降低有顯著關聯。 「我們發現，魚油補充劑並不是對每個人都有好處，這取決於你的基因型，」新研究的負責人葉凱雄說。「如果你有特定的基因背景，那麼魚油補充劑將有助於降低你的甘油三酯。但如果你沒有這種正確的基因型，服用魚油補充劑實際上會增加你的甘油三酯。」" 當然，研究人員也注意到這種關聯性研究固有的局限性。雖然可以追溯到這個基因及其對血脂的影響的合理機制，但還需要更多的重點工作來了解魚油補充劑如何與這些基因變異相互作用，並影響心血管健康。 不過，研究人員確實表示，這一新穎的關聯發現可以幫助解釋為什麼之前大量調查魚油補充劑和心血管健康的研究得出了相互矛盾的結果。「一種可能的解釋是，那些臨床試驗沒有考慮參與者的基因型，」研究人員指出。「有些參與者可能會受益，有些可能不會，所以如果你把他們混在一起做分析，你就看不到影響。」 如果得到進一步研究的驗證，這種基因與飲食的相互作用為精準營養這一新興領域提供了可信度。這個想法是，飲食策略可能不存在「一刀切」的建議，未來可以根據包括遺傳學在內的各種生理因素，為受試者專門定製營養建議。 「根據一個人獨特的基因組成，個性化和優化魚油補充建議，可以提高我們對營養學的理解，並使人類的健康和福祉得到顯著改善。」研究人員總結道。 這項新研究發表在《PLOS Genetics》雜誌上。 來源：cnBeta

在進化的歷史長河中，包括尼安德特人和丹尼索瓦人在內，許多人類近親都滅絕了，只留下我們依舊生活繁衍在這個世界上。這究竟只是單純的幸運，抑或我們有着什麼得天獨厚的優勢？今日，《科學》雜誌上發表的一篇論文，指出原因可能在於我們大腦里的一些基因變異。 ...

<pSteam免費福利又來了，今日(5月12日)大逃殺遊戲《基因變異（Geneshift）》在Steam上開啟免費領取活動，活動截止至5月14日凌晨1點結束。遊戲原價50元，Steam上總評為「特別好評」，遊戲支持中文。 <p點擊前往Steam頁面 【游俠網】)大逃殺遊戲《基因變異》限免預告 <p遊戲介紹： <p搜刮，生存，成為活到最後的人！暢玩一系列每局只需要3分鍾的超快速的大逃殺模式遊戲。就算你陣亡了，你還可以繼續作為喪屍來為下一局繼續搜刮物資。在單人戰役中拯救世界。你可以單人遊戲，也可以和其他3個在線好友進行合作。戰役模式的進度會和多人聯機的進度分享。 來源：遊俠網

<p玩家如果搜索Steam排行榜，會在流行榜上發現一款處於搶先體驗的獨立遊戲《基因變異》(Geneshift)，這款名不見經傳的遊戲與《絕地求生》和《俠盜獵車手5》之類遊戲混在一起顯得很奇怪。出現這一狀況，要得益於一位努力工作的遊戲開發者和海量的交易機器人。  <p這些交易機器人並非《基因變異》的開發者Ben Johnson所操控的。Ben Johnson花費了9年時間來開發這款《俠盜獵車手2》風格的俯瞰視角2D多人遊戲，並計畫於今年5月脫離搶先體驗階段正式發售。這些機器人來自那些使用獨立遊戲掉落的卡片放到市場上賣錢的人。這種濫用獨立遊戲賣錢的現象早已有之，Steam運營商Valve也清楚，但由於Valve本身也從卡片交易中抽成，因此雖然公司曾對這種機器人交易的行為有所打擊，但並未被真正根除。  <p一切開始於去年12月16日，Ben為了宣傳《基因變異》即將上線的大逃殺模式，宣佈遊戲可免費遊玩24個小時，並在reddit上發帖宣傳。使得廣大機器人用戶發現了該作的存在，在免費遊玩開售，瞬間有超過20萬的機器人湧入遊戲，因為數量巨大，Valve暫時關閉了這款遊戲的卡片收集。在此前一天，該遊戲的玩家人數峰值少於10人，在免費24小時開時候，玩家峰值達到213,183人。  盡管跌出了Steam在線排行榜，但《基因變異》仍登陸了流行榜(Trending)  <p盡管有海量機器人摻雜其中，但如此高的玩家峰值讓Ben吃了一驚。《基因變異》免費遊玩結束後，遊戲卡牌直到1月14日才重新開放掉落，此後，該作遊玩人數從20~50日再次飆升到114,920，盡管沒有之前的人數多，但仍然非常可觀。  <p再往後，機器人對遊戲的騷擾便告一段落，1月29日前，該遊戲現有玩家數從350人提升到1100~1600人：包括真人和機器人，只不過這次機器人可能只有上百個而非上萬個。  <p到了這個時間點，Valve已經不再禁止《基因變異》的卡牌掉落了：這麼做會觸怒玩家。而Ben認為「機器人入侵」對《基因變異》的積極影響高於消極影響。他已經得到了很多玩家的反饋，並着手於優化和改進遊戲。  <p但「機器人入侵」也留下了顯著痕跡：Steam統計的《基因變異》遊玩時間凝固在了5.1小時，與機器人需要獲得遊戲卡片所需的掛機時間相等。  來源：遊俠網