序幕：瑪而·薩拉
這里是瑪而·薩拉，位於克魯普星區的一顆邊緣行星，人類聯邦於2502年在這進行了再殖民活動，不過現在這里是自治聯盟的領地。
今天，自治聯盟的阿克圖洛斯·蒙斯克大帝舉行了一個記者招待會，為了紀念四年前結束的[怒火燎原]戰役。記者發出提問：「為什麼不擴充艦隊來對付蟲族，反而浪費大筆費用去追捕叛軍吉姆·雷諾。」蒙斯克大帝早就對這個問題做好了充分准備，他宣稱吉姆·雷諾是聯盟眼前的一大威脅，然後全力抹黑了雷諾的身份與所做所為。
此時，吉姆·雷諾正坐在瑪而·薩拉的一家酒館里，獨自喝着悶酒。他看着電視上這則猶如狗屁的新聞，再翻開手中照片看了看，那是他曾經的愛人，美麗的莎拉?凱莉根，可現在卻變成了致命的刀鋒女皇，這一切全都是因為蒙斯克這個混球，而這混球此刻正在電視上大放厥詞。雷諾突然惱羞成怒，舉槍擊碎了熒屏，並叫出了自己的副官，一個人工智能，看樣子她知道雷諾要做什麼，軍隊早已備好，只等雷諾下令了。
第一章：解放日
任務簡報：迴水基地是自治聯盟在瑪而·薩拉的運輸中心。摧毀這里的自治聯盟政府就能癱瘓蒙斯克大帝在行星上的所有行動。
可用單位：雷諾，陸戰隊
主要目標一：摧毀自治聯盟總部
主要目標二：雷諾必須生存
可選目標：摧毀所有帝國宣傳台
成就：
解放日：在達成所有任務目標的狀態下，完成任務「解放日」
雷諾再現：在普通難度的任務「解放日」中，讓雷諾擊殺5名敵方單位
打到蒙斯克：在困難難度的任務「解放日」中，擊殺所有敵方單位
雷諾向副官詢問了此次任務的咨訊，得知自治聯盟的運輸中心最近正處於兵力不足的狀況，當地人民也是出了名的反聯盟份子。雷諾聽完後馬上決定了作戰策略：趁虛而入，直接奪取蒙斯克的總部。
一切就緒，雷諾長官帶着幾名陸戰隊弟兄搭上了維京戰機，我們選擇在西南方的斷橋處着陸。運輸機撤離後，雷諾讓大家擺開陣勢，沿路向東進軍。不一會就走進了居民區，天吶！這里簡直與廢墟沒兩樣，遍布着燃燒的建築與廢棄車輛。路上有一位好心居民提醒我們別再往前了，但雷諾早已不再懼怕任何麻煩，只管帶隊繼續向前。在路口乾掉幾個敵方哨兵後，我們發現不遠處有一座全像儀，原來是蒙斯克這傢伙建造的帝國宣傳台，播放的全是給居民洗腦的陳詞濫調。副官告訴雷諾，如果把此地所有全像儀都摧毀的話，這里的反叛軍將會被激發來幫助我們。其實不用副官開口，雷諾也早就想要轟爛它，因為全像儀上那張臉已經讓他受夠了。之後我們在路旁發現一位傷心的居民，他的家人與鄰居全都失蹤了。
來到一個寬闊的廣場前，我們發現已有大批敵軍嚴陣以待，還好我方留有一手，雷諾讓副官空投了之前說好的「特別快遞」，突如其來的援軍把敵人嚇了一跳，我們里應外合，突破了敵方防線。與援軍會合後，我們在廣場中央發現一座全像儀，兄弟們二話不說就把它轟掉了。走到西北方的路口時我們發現了本地居民，帝國把他們抓到這里來集合，強迫他們去做礦工。其中有一位年輕人，他哥哥在上禮拜被抓去後就不見了，他不願步此後塵，在守衛不注意時趁機逃跑，但守衛很快地反應過來並射殺了他。雷諾不知有多少次親眼目睹過帝國這樣的暴行，他憤怒的命令大家沖過去。救下居民後，雷諾得知運輸中心那邊還有很多被抓去的人。我們往前找到其餘居民後，他們全都加入了我方，變成反抗軍的第一件事就是毀掉眼前煩人的全像儀。居民們不斷歡呼着，與我們一起攻向前方的聯盟基地，這里的防守正如副官所說般薄弱。片刻間，敵人總部被轟成了爛泥，居民們不敢相信自己居然推翻了聯盟的政權，雷諾告誡他們以後不要任由蒙斯克處置，然後把這里的武裝全分配給了居民。
任務回來後，雷諾仍每天泡在酒館里。某天，突然有一名穿着陸戰隊服的彪形大漢走進酒館，他邁着沉重的腳步，從後面一步步逼近雷諾，還說自己是專程來找通緝犯的。雷諾警惕起來，把手從酒杯緩緩靠近一旁的手槍，准備隨時迎敵。但當大漢把面罩打開，並親切的叫他一聲「小吉·雷諾」後，雷諾認出了他的聲音，原來是泰科斯·芬利，是以前的老搭檔了。他們放鬆下來，互相侃談了一番。閒聊後，泰科斯向雷諾提出了一個「商業提案」，蒙斯克目前正在瘋狂地挖掘外星神器，而泰科斯認識一個願意為神器支付高額費用的買家，他倆經過一輪討價還價後，最終達成了合作協議。
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第三章：關鍵時刻
任務簡報：神器已經取得，交通工具也已經在路上了，在離開瑪而?薩拉前我們先在迴水基地等候，不過要隨時注意自治聯盟的保衛軍。
重要建築：碉堡
主要目標：堅守20分鍾直到撤離
可選目標：營救起義軍
資金獎勵：55000
成就：
關鍵時刻：在達成所有任務的情況下完成任務《關鍵時刻》
堅守陣地：在不損失或是回收任何建築的情況下完成普通難得的任務《關鍵時刻》
攻擊就是最好的防禦：在困難難度的任務《關鍵時刻》中，摧毀4座蟲族孵化所
雷諾已經找了運輸機過來，他說我們只要坐着等就好了，聽上去倒是蠻簡單的，泰科斯建議我們趁機好好放鬆一下。正說着，副官突然就探測到蟲族反應，雷諾指責泰科斯故意隱瞞了關於蟲族的事情，但泰科斯發誓自己絕不知道什麼蟲族。沒辦法，雷諾只有緊急部署作戰方略，他讓大家利用基地門口的碉堡盡可能把蟲族擋下來，一直撐到運輸機抵達為止。真正的大戰即將考驗我們。
部署完畢後，我們讓陸戰隊進駐碉堡，必須固守20分鍾的時間，訓練更多的陸戰隊才能渡過這個難關。現在兵營可以建造附屬反應爐了，用它能夠一次訓練2名陸戰隊，而另一個兵營還是訓練醫護兵MM吧，她們必不可少。蟲族的速度快極了，才一會功夫就派了跳蟲過來，我們匆忙應戰，但蟲子們只是來打探虛實的，真正的考驗還在後面。我們派了幾個工程車過來，它們能夠自動修理碉堡，索性就留在這了。之後我們收到幾條求救訊息，是基地附近的起義軍，助人為樂一向是我們的宗旨。剛回到基地又發現了蟲群，好不容易打爛它們，正想休息一下，就聽到泰科斯發出的警報，他偵測到幾個空中怪物，是飛龍！還好我們事前部署了飛彈炮台，不過這要命的襲擊速度真讓我們忙得焦頭爛額。
接下來要在電機工程所升級步兵的攻擊與護甲，這能夠幫我們有效抵擋蟲群。雖然蟲族增派了刺蛇參與進攻，但我們的防守牢不可破。之後蟲群的攻勢一波比一波猛，我們拼了老命才勉強擋了下來。在最後一分鍾的時候，雷諾終於接到了麥特·霍納的報告，援軍就要到了。而此時蟲族正如洪水般襲來，蟲群已升級為蟲海，數不盡的怪物猛烈地沖擊着我方防線，兄弟們已經快抵擋不住了。還好麥特艦長及時趕到，海伯利昂號上如同火雨般的攻擊成功幫我們阻止了蟲族。
正要撤離時，飛龍群占領了天空，麥特令戰艦集中火力，向前殺出一條血路。但飛龍實在太多了，我們被迫進行了傳送跳躍才逃脫蟲群的包圍。之後雷諾向麥特詢問目前蟲族的狀況，麥特讓他自己看看新聞，原來蟲族已經發動了全面攻擊，目前已對人類造成數十億傷亡，而統領蟲族的正是刀鋒女皇。看到這，雷諾一屁股癱坐在椅子上，沉思許久後說出一個結論：凱莉根是回來消滅我們的。片刻後，麥特建議盡早准備各種軍械彈藥，雷諾提到了兵工廠的史汪，相信他已經為我們准備好了。對於泰科斯的同行，麥特表示出不滿，雷諾好說歹說才說服了他。
第四章：疏散行動
任務簡報：位於阿格利亞行星的艾瑞兒·韓森博士發出了一條求救訊號，蟲族已經包圍了那里，而自治聯盟把他們遺棄了，那里只是個農業殖民地，沒有任何抵抗力量，必須趕在他們被包圍前救出他們。
新增單位：火焰兵
主要目標：護送移民到達移民船
可選目標：收集異蟲蛹DNA
資金獎勵：100000
蟲族研發：+3
從這一章起可以收集研發科技了，以後的實驗室會用得到。
成就：
疏散行動：在達成所有任務目標的情況下完成任務《疏散行動》
小心易碎：在不損失任何運輸車的情況下完成普通難度任務《疏散行動》
永不犧牲：在不損失或回收任何建築的情況下完成困難難度的任務《疏散行動》
雷諾回復了韓森博士的求救訊號，並向她詢問了當前情況，得知蟲族已攻克了那里的行星防禦，韓森博士希望我們幫忙守住幹道，以便運送難民們離開。
史汪找來了幾個火焰兵，他們是燒烤蟲子的專家，我們讓醫護兵MM跟着他們一起去了阿格利亞。抵達後先往西去與韓森博士會合，路上蹦出的跳蟲統統被烤焦了。碰面後博士把基地交由我們管理，接下來就要護送第一批移民了。護送途中雷諾發現了被聯盟遺棄的碉堡，如果讓士兵進駐的話對護送會更加有利。在星際港前我們發現1個異蟲蛹，若不是斯特曼博士要收集蟲族的DNA，我們寧死也不去碰這鬼東西。第三次護送時我們遇到一些飛龍，兄弟們給它們餵了很多子彈。片刻後麥特發來警報，蟲群已經進入大氣層並開始逼近我們，看來得抓緊時間了。第四批移民做好准備時，我們看到天空逐漸昏暗，不詳的預感飄然升起。護送時蟲群突然從天而降，打了我們個措手不及，但兄弟們還是勉強撐了過去。當最後一批移民行動時，天色已經黑了，麥特再次發來警報，某種會挖地道的蟲子正帶着一股股強烈的震波由地底接近我們。這是在這條路上最後的征程了，可蟲族不會讓我們順利通過。剎那間，地下蠕蟲伴隨着大量蟲子從地面冒了出來，這傢伙絕不是一般的大，但無論如何我們都要沖過去，犧牲了好幾名弟兄後，我們終於脫離了險境。
韓森博士失去了殖民地，她決定暫時待在海伯利昂號上，麥特向雷諾推薦博士的科學技能，雷諾很高興的接受了她。之後雷諾去戰艦上新開張的酒館與希爾見了一面，他是聯絡雇傭兵的行家，此次為雷諾找來了一些不錯的雇傭兵。
第五章：強行奪取
任務簡報：莫比斯基金會發來一個任務，他們就是泰科斯之前說過的買家，這次我們要去蒙利斯星球尋找另一個神器。但那里好象有一群自稱為塔達力姆的狂熱神族在守護着。
新增單位：掠奪者
主要目標：奪取外星神器
可選目標：收集星靈聖物
資金獎勵：110000
神族研發：+4
成就：
強行奪取：在完成所有任務目標的情況下完成任務《強行奪取》
堅若磐石：在不讓任何單位死於神族石像守護者手中的情況下完成普通難度的任務《強行奪取》
打帶跑：在15分鍾內完成困難難度的《強行奪取》
雷諾與泰科斯正在查看神族守護的聖殿時，突然發現大量蟲族在此地出現，這下事情復雜了。不過雷諾想出了一個不必兩面受敵的策略，他讓我們降落在聖殿西南方，趁蟲族與神族打得不可開交時突入聖殿，然後布下防禦，堅守到神器提取完成後就撤離。
基地剛剛架起，就有幾個神族追獵者過來找麻煩，史汪及時給我們送來了一些掠奪者，聽說他們的轟炸能力很強，追獵者被擊垮後證實了這一說法。我們在此地發現了幾個星靈聖物，斯特曼要我們把這些古董收集起來。這次我們可以使用希爾給我們找來的傭兵了，「戰豬」是強大的精英陸戰隊，「惡魔犬」能給我們提供更加猛烈的火焰，有了足夠的資源就在傭兵基地雇傭他們吧。有了強大的軍隊後就可以揮師東進了，但我們在神族的能量橋上碰到一點麻煩，他們的哨兵利用力場把橋口堵住了，再加上光子加農炮的威脅，我們不得不先撤退。後來我們想到了破敵的辦法，先過去把哨兵幹掉，然後等待力場消失再一口氣沖過橋摧毀加農炮。接下來得把前方的神族基地摧毀掉，才能到達聖殿中心。但在此之前我們必須加強基地防禦，因為討厭的蟲子總喜歡過來搗亂。在突破重重困難後我們終於看到了神器，但是剛踏入聖殿的中心，整個聖殿突然發生劇烈搖晃，等我們緩過神來，周圍的幾尊巨大石像居然「活」了過來，它們是傳說中的石像守護者！強大的光束燃燒着我們，好幾個兄弟因此犧牲，我們只能集中火力把它們逐個擊倒，真是一場慘烈的戰鬥。占領聖殿後史汪迅速派了運輸機來取走神器。撤離時傳來一個恐怖的聲音，竟來自於刀鋒女皇，她警告雷諾：此役後蟲族不會再犯同樣的錯誤了。而雷諾只是無奈從嘴里呼出她的名字：凱莉根。
麥特發現泰科斯越權進入了資料庫，泰科斯解釋說只是想了解下目前狀況，並對刀鋒女皇嗤之以鼻，他顯然不了解凱莉根的過去，麥特正好為他做了一點說明。之後麥特向雷諾報告了此事，雷諾不以為然。有了樣本後，實驗室的斯特曼終於忙碌起來，他提出了一些研發計劃，但那還需要更多樣本。雷諾表示沒問題，只是希望他別做得太過火。
第六章：暴走
任務簡報：韓森博士提出一個請求，由於星域內的難當成了中繼站，導致那里擠了太多人，疾病已經開始蔓延，她希望我們能挽救局面。新增單位：惡狼
主要目標：淨化蟲族感染
可選目標：消滅感染蟲
資金獎勵：110000
蟲族研發：+2
成就：
暴走：在達成所有任務目標的情況下完成任務《暴走》
28分鍾後：在第5個夜晚來臨前完成普通難度的任務《暴走》
惡夜獵殺：在困難難度任務《暴走》中，與夜間摧毀15棟被感染的建築
韓森博士在向雷諾展示曼霍夫星球上的情況，他們看到某種生化感染物正在覆蓋整個難民營，就連建築物都難逃魔爪。雷諾想起來了，這是一種蟲族病毒，必須把它們燒掉，連同被感染的建築一起淨化。韓森正奇怪怎麼看不到半個人時，突然從地底鑽出一種人形怪物，原來是被感染的難民，他們已經被蟲族控制了！不過病毒受不了此地的高強度紫外線，感染者只能在晚上活動。了解情況後，雷諾決定讓我們晝出夜伏，逐漸淨化感染。
當我們的基地在曼霍夫建起時，太陽已經快落山了，雷諾下令趕快做好碉堡等防禦工事。夜幕降臨時，可怕的哀號不斷從四處傳來，讓人聽得毛骨悚然。大堆感染者逐漸逼近我們，他們已經不成年人樣，全變成了醜陋的怪物。我們瘋狂扣動扳機，只看到感染者血流成河，一個個倒在碉堡前。正要歡呼時，突然有一個感染者開口拜託我們殺了他，原來難民們還殘存着自己的意識，本着人道主義的精神，我們結束了他的痛苦。黎明時分，史汪送來了惡狼戰車，這傢伙憑着一張結構圖就造了出來，本事還真不小。
剛躺下幾分鍾，雷諾就把我們叫了起來，搞破壞的時間到了。惡狼戰車擔當起此次主要任務，一整天時間他們燒毀了好幾座被感染營地。天黑前副官掃描到一種會鑽地的蟲族生物，麥特說斯特曼需要它的屍體樣本。第二夜，有一些被感染的陸戰隊員襲擊了基地，我們只能終結了他們的痛苦。第三夜，惡狼找到了那些藏匿的蟲族生物，是感染蟲！原來這里的病毒全部出自於它。下半夜，惡狼帶着感染蟲的屍體回到了基地，南面的路障就在這時被突破了，我們只得過去重新建造防禦工事。第四夜，本以為沒什麼特別的，但聽到夥伴們驚呼時，抬頭望去只看到一頭高大的變異體向我們沖來，所有隊員出於本能集中火力轟向它，但它強壯的身軀承受了我們無數子彈後才轟然倒下，碉堡都被它抓出了好多裂痕。很難想象這麼可怕的怪物是由什麼變異而來的，人類？？第五天，我們終於把這充滿死亡氣息的地方給燒盡了。韓森博士希望能帶她的人民去往絕對安全之地，雷諾不知趣的打斷了她，但博士相信一定存在着某個尚未被外星人探索的天堂。
過了些天，韓森博士找到了一顆名叫海文的行星，它很靠近神族領域並且從未被侵占，看起來很安全。雷諾建議他們最好保持低調，麥特則擔心他們是否受到了感染，博士聽後有點不高興，但為了安全起見她決定試着研究病毒的解藥。
第七章：惡魔樂園
任務簡報：一個叫蓋布瑞?托許的海盜向雷諾發出了邀請，他希望與我們在紅石星球展開合作，這里的礦石能夠讓我們雙方都大賺一筆，不過需要注意一下侵入這里的蟲族。
新增單位：死神
主要目標：採集紅石星球上的晶礦
可選目標一：找到托許的礦工
可選目標二：獵殺殘暴蟲
資金獎勵：110000
蟲族研發：+3
成就：
惡魔樂園：在完成所有任務目標的情況下完成任務《惡魔樂園》
鮮紅龍蝦：在普通難度任務中用岩漿燒死殘暴蟲
死神之友：在困難難度任務中找出所有托許的小隊
雖然接受了邀請，但雷諾似乎不太喜歡這個星球的火山。托許在通訊中對雷諾表示歡迎，並說明了這次任務的風險：這地方的熔岩比較活躍，每幾分鍾就會爆發一次，礦區常會被岩漿淹沒，另外還有蟲子出沒。
這個星球簡直熱得要命，我們仿佛站在滾燙的鍋子上，全身汗流浹背。不出一會，副官發來岩漿警報，我們趕緊讓工程車回基地來避難，岩漿如潮水般席捲了低窪地帶，溫度再次彪升，流出的汗水幾乎被蒸發無蹤。岩漿退去後，麥特給我們送來一個熔岩噴發計時器，這東西實在太有必要了。托許派了幾個弟兄過來幫忙，史汪說他們是被譽為死神的狠角色。另外我們要去北方搜索一下托許雇傭的礦工，他們失蹤了。片刻後，斯特曼探測到一隻大傢伙在基地附近，好象是殘暴蟲，他對此很有興趣。麥特提醒我們，如果在軍事上耗費過多晶礦，采來的礦石就不足以完成任務了，必須要顧好兩者之間的平衡。找到托許的礦工後，雷諾讓他們負責採集北方的晶礦。剛開工，計時器就報警了，我們只得撤回高地躲避。退潮後，該讓死神們大顯身手了，我們一起去尋找斯特曼所說的那隻殘暴蟲。耐着高溫走了好長一段路，終於在南邊發現了它。這是個非常可怕的傢伙，兩手鋒利的巨鐮直看得人不寒而慄，不過它行動緩慢，腳下靈活的死神與它打起了游擊戰。經過了漫長的戰鬥，大怪物終於被打成了蜂窩，而死神們沒一個受傷的，果然名不虛傳啊。
回到基地，這邊的晶礦已經快枯竭了，托許及時給我們標示了新礦點。指揮中心能夠升空飛行，我們讓它降落在新礦點旁邊，開采工作再次進行。討厭的蟲子會時不時的跑來干擾，火焰兵只得當起了工程車的保鏢。死神們在外上刀山下火海，極力尋找四處散落的晶礦，但卻意外發現了一些同行，原來他們也受僱於托許，為了同一個目標，他們參與了行動。最後在托許與我們的共同努力下，晶礦採集完成，他親自見識到了雷諾的實力，決定繼續與我們討論更多的生意合作。
回到戰艦，雷諾發現托許混了上來，他想要直接與雷諾本人談更多的「創投」。麥特已經做好了調查，托許並不是什麼海盜，而是從自治聯盟叛逃的幽靈特工，還做過許多對蒙斯克不利的事，雷諾覺得托許與自己也算是同道中人，便收留他。不過防人之心不可無，麥特受命要隨時提防托許。
第八章：叢林歡迎你
任務簡報：托許在貝爾石行星上發現一種稀有瓦斯，神族認為它是神賜的禮物，取名「造物者之息」，而在人類的理解中它就是態化氫，可以賣出非常好的價錢。想要得到它的話必須冒着被神族殺掉的危險。
新增單位：巨人
主要目標：奪取態化氫
可選目標：尋找星靈聖物
資金獎勵：120000
神族研發：+3
成就：
叢林歡迎你：在達成所有任務目標的情況下完成任務《叢林歡迎你》
破壞欲：在普通難度的任務中，不讓任何的SCV被神族擊毀
簡單的要命：在困難難度的任務中，不讓神族封鎖任何態化氫採集點
這個星球比紅石漂亮多了，盡管如此，雷諾卻不怎麼高興，他不太想與神族戰鬥。但不管怎麼樣，作戰行動還是得進行。為了對付神族的空中部隊，雷諾讓史汪把巨人的結構圖載入軍工廠系統，他們的防空飛彈應該能起到作用。
登陸後，托許給我們標出了所有態化氫的坐標位置，總共13處，它們都被神族用容器裝着。史汪說可以利用工程車來採集這些瓦斯，只要採集7罐就行了。如果被神族發現，他們會開始封印容器，超過7個被封印的話，任務便無法完成，所以我們得比他們更快。有一個態化氫罐離基地很近，我們首先收集了它。神族的執行官發現此事，對我們發出了警告，雷諾連忙解釋說只是想要一些這種氣體。但神族顯然對這瓦斯很在意，他們開始行動了。要趕在他們封印7個容器之前完成收集，麥特建議我們一次只採集一個態化氫罐，並給工程車派重兵全程隨護。
這是一場與神族的時間競爭，他們封印容器的同時，我們在另一處收集態化氫，速度快的一方就是贏家。可神族不會眼睜睜的看着我們褻瀆聖物，當工程車在採集態化氫時，神族會同時派出地面與空中部隊進攻我方，我們最好用掠奪者與巨人來應付，讓陸戰隊與醫護兵做輔助的話效果不錯。收集態化氫的途中我們還發現了幾個星靈聖物，斯特曼一定很需要它們。如果膽子放大一點，我們可以派出2輛工程車去採集臨近的2個態化氫罐，然後讓部隊在附近巡邏，或者是分派兵力去阻止神族的封印，成功的話能夠為我們爭取不少時間。忙碌了好半天，我們才順利帶着態化氫離開了此地。
戰艦上收到一份加密信息，上面顯示托許正在執行一個名為「影刀行動」的機密任務，之前幫他採集2種資源中含有能夠強化他們的成分。托許眼見瞞不住了，就主動向雷諾承認，他們是被稱為「幽魂」的次世代幽靈特工。雖然藏有秘密，但托許表示不會對雷諾造成威脅。雷諾放心不下，讓麥特去核實剛剛的消息，不過消息來源暫時無法追蹤。托許懷疑這是蒙斯克的離間計，雷諾則覺得應該先查清楚再說，最後他警告托許最好先安份點。
第九章：拯救海文星
任務簡報：韓森博士的人民又出了新狀況，他們可能被蟲族病毒感染了，導致海文星上整個新殖民地失去了聯絡，由於擔心神族會對她的人民不利，博士請求雷諾過去看看。
新增單位：維京戰機
海伯利昂號正在接近海文星，殖民地始終無法聯絡上。此時我們發現了一批神族艦隊位於行星軌道上，原來是他們攔截了海文星的通訊，艦隊的主武器正在啟動，雷諾急忙讓麥特給神族發出聯絡。通訊連上了，一個叫席倫蒂絲的神族執行官向雷諾問好，她聽說過我們長官的英勇事跡。雷諾禮貌性的回復了她，然後要求她把艦隊撤走。席倫蒂絲給出條件，除非我們願意代替神族淨化殖民地，否則他們不會坐視不管。韓森博士不肯答應，她說解藥已經快研製好了，只要我們為她爭取一些時間。席倫蒂絲讓雷諾自己選擇，她堅信只有火焰才能淨化蟲族的感染。
這一章將出現2個選擇，幫助韓森博士或是幫助神族，只能選其一。
選擇之一：保護殖民地
主要目標一：摧毀神族星核
主要目標二：摧毀「淨化者」
可選目標：阻止神族艦隊
資金獎勵：125000
蟲族研發：+3
成就：
拯救海文星：在達成所有任務目標的情況下完成任務《拯救海文星》
此路不通：在普通難度的任務中挽救3個殖民地哨站
我的寶貝：在困難難度的任務中挽救2個殖民地哨站
就算只有一絲希望，雷諾還是決定拯救殖民地，與神族的戰鬥是不可避免了，席倫蒂絲表示他們將會全力以赴。片刻後我們看到神族開始接近殖民地，他們派出的「淨化者」是一艘巨大的聖母艦，聽說它擁有摧毀整個星球的能力，還有星核為它提供的強大保護場。雷諾讓我們先把所有人疏散到主基地，如果神族保持他們的一貫作風，「淨化者」就會有條理的對殖民地逐個淨化，這是我們唯一的指望。史汪傳來消息，他拿到了維京戰機的結構圖，這是一種擁有空陸雙形態的機械。不過想要對付神族，必須先摧毀他們的星核，然後才來解決那艘聖母艦。
來到主基地不久，麥特標記了神族星核的位置，我們得擁有一支強大的軍隊才能進攻。還有一些難民沒來得及逃到我們主基地，神族一定會派艦隊殺光他們，我們最好用維京戰機阻止這件事。不一會，「淨化者」出現了，它正飛向南邊的一個殖民地，還好那里的難民都已經轉移了。片刻後麥特偵測到大量的高能量信號，「淨化者」開火了！我們在主基地都能感受到來自遠方的震動，只見南面一片火光，真慶幸我們不在那里。這時神族派出了艦隊，目的是西南方的殖民地，得馬上派出維京去搞定他們。
地面部隊已經整裝待發，我們先攻擊了附近的星核，神族的防禦很薄弱。接下來我們趁勝南下，第2個星核輕松打掉。此時的軍隊勢如破竹，直接奔向最後一個星核，只要避開聖母艦，沒什麼能阻止我們。摧毀所有星核後，「淨化者」失去了保護，麥特建議我們馬上擊落它。與維京會合後，軍隊一舉攻向「淨化者」，本以為它失去保護會不堪一擊，沒想到一個黑洞突然出現在我們面前，一些部隊被倦了進去，我們都嚇壞了，麥特急忙告訴我們，這效果只是暫時的。謝天謝地，過了一會兄弟們又回到了戰場上。不過神族的聖母艦確實不是蓋的，就算失去了保護場，可是在我們全軍的圍攻下，仍然堅持了很長時間才被擊毀，真希望下次別再遇到這東西。母艦被毀後，神族被迫撤退了，席倫蒂絲似乎沒有想象中的那麼憤怒，雖然輸給我們，但她希望雷諾的信念是正確的。
與韓森博士道別的時候到了，她必須回去幫助難民們。臨走時，她想讓雷諾留在海文星，與她一起生活，我們從沒看過她如此柔情的這一面。不過雷諾婉言推託掉了，他身上還有着更重要的使命。韓森理解這一點，她突然吻了雷諾，權當道別，然後依依不捨的走出了海伯利昂號。
選擇之二：淨化殖民地
主要目標：清除異蟲感染
資金獎勵：125000
神族研法：+3
成就：
海文星淪陷：在達成所有任務目標的情況下完成任務《海文星淪陷》
門診時間：在普通難度的任務中保護3個殖民地免於蟲族感染
到府問診：在困難難度任務中保護5個殖民地免於蟲族感染
雷諾覺得神族執行官說得有理，蟲族感染只能通過烈焰來治癒。韓森博士極力反對，她的解藥就快研製出來了，可雷諾卻無動於衷。他決定由人類自身來解決自身的問題，執行官贊同雷諾的說法，答應把此事交給我們。接下來是討論作戰的時間，雷諾決定先拔掉散播病毒的建築。另外，史汪派了很棒的幫手給我們，那就是擁有空陸雙形態的維京戰機。
着陸後，麥特開始探測敵情，他發現散播瘟疫的是蟲族噬病毒，守護它的是寄生王蟲，這些怪物對地非常致命，我們只能用維京戰機從空中給予打擊。雷諾讓我們穿好防護服，免得被病毒感染，然後着手訓練軍隊，那些喜歡縱火的傢伙必不可少，期間我們還派維京擊落了附近的寄生王蟲。士兵充足後，我們向着噬病毒進發，為了防止基地空虛，工程車修起了防禦工事。噬病毒就在基地不遠處，看上去真是個惡心的傢伙，不斷噴出帶着病毒的綠色汁液，真擔心防護服是否能抵抗這種東西，趕緊消滅它才是王道。好不容易淨化這一區後，麥特說有另一區殖民地正被蟲族感染，得趕在完全感染前把未成型的噬病毒消滅，地面部隊是來不及了，只能派維京戰機過去，還好感染體的守衛大多是飛龍與寄生王蟲，維京不辱使命，成功阻止了感染蔓延。
後來我們的軍隊不斷摧毀了好幾個噬病毒，火焰點亮了每處被感染的殖民地。蟲族不得不派出強悍的變異體阻止我們，不過有了在曼霍夫對付它的經驗，轟爛它不是什麼問題。過了一段時間，雷諾接到麥特的報告，韓森博士正把自己一個人鎖在實驗室里。博士很在乎她的人民，真不知她會做出什麼事來。一番努力後，海文星上再也沒有任何噬病毒，我們成功了，可是船上一定多了個大麻煩。
為了防止意外，雷諾穿着戰甲到實驗室去找韓森博士，進去後沒看到任何人。他讓麥特把出入口封閉起來，繼續尋找任何蹤跡。當來到一個培養皿前，有個東西突然出現，天呀！這是韓森嗎，那可怕的面孔已不再是我們認識的博士。原來她受到感染，變成了蟲族的奴隸！她恨雷諾，恨透了剛剛我們的所做所為，韓森不顧一切襲向雷諾，但她明顯不是對手。奄奄一息時，她哀求雷諾殺了自己，看來博士的人性並沒完全被病毒奪走。雖然不忍，雷諾只能結束掉她的痛苦，可憐的韓森懷着怨恨死去了。
第十章：驚天快劫
任務簡報：麥特收到一份最新報告，塔桑尼斯有許多自治聯盟的補給火車在活動，且防禦力薄弱，如果我們劫下火車，將獲得非常豐厚的收益。
新增單位：響尾蛇
主要目標一：攔截帝國火車
主要目標二：不能放走3列火車
可選目標一：找到響尾蛇戰車
可選目標二：收集蠍蟲的蟲骨樣本
資金獎勵：110000
蟲族研發：+3
成就：
驚天快劫：在達成所有任務目標的情況下完成任務《驚天快劫》
欺凌惡霸：在普通難度的任務中消滅一支掠奪者小隊
銀色閃電：在困難難度任務中不讓任何火車通過
麥特通過熒屏向雷諾說明了此次任務，自治聯盟今天要運送某個貴重物品，但我們無法查出是由哪一輛火車裝運，所以最好把每輛火車都攔下來碰碰運氣。雷諾覺得這樣做不太穩妥，但他也想不出更好的辦法，只能幹了。
登陸後，麥特偵測到幾輛老聯邦留下的車輛分布在四周山坡上，史汪告訴我們這是響尾蛇戰車，它的磁軌炮能夠很好的阻擋帝國火車，我們應該馬上奪過來。知道有新玩意，兄弟們都迫不及待地出發了，我們很快就在周圍尋得了幾輛，而且還在路旁發現了很大的蟲族殘骸，斯特曼肯定會用到它。回到基地，史汪已經把響尾蛇結構圖傳入了軍工廠，這下可以批量建造了。不一會，西北方有火車開過來，我們正好可以帶着響尾蛇過去試試戰力如何。發現火車後，弟兄們奮力開火，想要迅速轟掉它，但火車很堅固，我們逐漸被它甩在了後面，這時響尾蛇戰車發揮了它的特長：移動攻擊、強大的火力以及不遜於火車的速度。不出片刻，火車被毀了，我們上前查看貨物，雖然沒發現麥特所說的貴重物品，但有很多資源被我們帶了回去。
自治聯盟發現我們的行動後，給火車派了護衛軍，但是這點兵力休想阻止兄弟們，另一輛火車再次被我們劫下。完事後，麥特發現聯盟想要襲擊我方基地，看來他們還不算太笨，我們只得先回去把防守做好。來襲的敵軍數量不多，可能他們沒有多餘的兵力了。接下來我們在軌道附近發現了一些敵方碉堡，以現在的軍力，大家兩三下就能毀掉任何碉堡。接連攔截幾輛火車後，帝國似乎被激怒了，不知他們去哪找來了一批援軍，麥特說這是掠奪者獵殺小隊，最好避開他們。但我們可不吃這一套，軍隊戰意旺盛，沒一頓大餐的話怎麼能滿足兄弟們。血戰過後，我方有所傷亡，不過除掉了一個大麻煩比什麼都好。補充兵力時，史汪發來報告，不知聯盟用什麼方法讓他們的火車提了速，看樣子我們只能靠響尾蛇來追擊了。當第八輛火車出現時，聯盟派出了最龐大的護衛軍，泰科斯提醒我們最好小心一點。這次確實不好對付，辛苦劫下火車後，里面沒有發現滿滿的資源，但我們卻再不用打劫火車了，因為貴重物品就在這里。把箱子打開後，發現一個老舊的聯邦副官，帝國費了那麼大勁，一定有什麼秘密藏在她身上，雷諾決定要親自弄清楚。
取回那個老副官後，我們把她安放到實驗室去充電。之後雷諾進去審問她，但她拒絕回答，因為在她的資料庫里，雷諾的身份是個罪犯，看樣子只能先找到破解專家再說了。
第十一章：割喉戰
任務簡報：麥特想到一個老傭兵，歐蘭上校，他是破解聯邦密碼的專家，我們應該能在被稱作「傭兵天堂」的亡人港找到他，雖然他不是很信得過，但這是目前最好的選擇了。
新增單位：禿鷲
主要目標一：趕在歐蘭之前雇傭米拉
主要目標二：摧毀歐蘭的傭兵要塞
可選目標：找到走私的星靈聖物
資金獎勵：120000
神族研發：+3
成就：
割喉戰：在完成所有任務目標的情況下完成任務《割喉戰》
掃雷者：在普通難度的任務中用蜘蛛雷擊殺25個單位
玩牌時間：在困難難度的任務中簽下米拉的合約前不訓練SCV
海伯利昂號正停在危險的亡人港附近，等待着歐蘭上校破解完成。但他的速度也太慢了，雷諾有了種不好的預感。剛說完，一個叫米拉的傭兵頭目就聯絡進來，她說歐蘭的破解已經完成了，但他打算把里面的秘密賣給自治聯盟，米拉是歐蘭雇來阻擋我們的。這老傢伙果然是信不得啊，但米拉為什麼要說出這些呢，原來她是想做筆交易，只要我們出的價錢與歐蘭一樣，她就會幫我們，雷諾爽快的答應下來，不過我們必須比歐蘭先付酬勞才行。米拉要的酬勞是晶礦，但這里的天然礦石寥寥無幾，我們只能去回收廢鐵了。
基地降落後，麥特說這里有很多被海盜拆卸的船艦，把這些廢鐵都收集起來的話應該足夠支付米拉的傭金了。兄弟們立馬出發，這里的廢鐵散布各處，不多花一點時間可不行。北邊有一個搗碎機，麥特建議我們每隔一會就去看看，因為它會不斷生產廢鐵。那個叫米拉的傭兵似乎對我們艦長有點意思，她送來了幾輛戰車，老泰科斯一眼就認出了這是超經典的禿鷲，雷諾說這些傢伙的地雷可以用來布防。在基地周圍埋下地雷後，我們帶着禿鷲攻上了北邊敵營，他們在這里採集礦石，拔掉這個基地的話，能夠有效延緩歐蘭籌集傭金的時間，同時我們還可以在這建一個新的基地來采礦，只需做好防禦工事就不必擔心了。接下來我們在南邊收集了好多廢鐵，還在一些大型廢棄物後面發現了走私的星靈聖物，斯特曼急需用到它們。軍隊隨之不斷壯大，具有一定規模後，我們拔掉了歐蘭的其他采礦基地，這下歐蘭肯定付不出傭金了。
我們順利把高額傭金支付給了米拉，她則把所有軍隊都交給了我們。歐蘭氣急敗壞的向着米拉發難，但她的傭兵可不太好惹，個個都是精英，歐蘭的攻擊沒能奏效。與米拉會師後，我們全軍攻向歐蘭的老巢，身後還帶着米拉的攻城坦克，這東西的攻城模式是所有地面單位的噩夢。攻到敵人基地下方時，歐蘭給我們准備了一個「小禮物」，這老傢伙真是豁出去了，他弄了一顆核彈過來！我們可不敢陪他玩，趕緊將軍隊撤出了爆炸范圍。後來軍隊沖上了歐蘭的基地，這里有一艘戰巡艦，為了避免傷亡，我們趕緊讓巨人轟掉了它。在堡壘崩潰前，老傢伙終於投降了，他交出了聯邦副官，但雷諾已然被激怒了，他讓米拉把歐蘭冰凍了起來，需要用到時才會放出。
回到艦上，雷諾再次審問聯邦副官，他問了有關蟲族進攻塔桑尼斯的事情，結果令人吃驚。副官讀出所記載的信息：一個叫杜克的人為蒙斯克准備了一台幽能發射器，這東西能夠吸引蟲族，蒙斯克想讓蟲族來幫自己消滅聯邦。凱莉根極度反對這個做法，因為這會使整個星球都毀滅，雷諾當時也支持凱莉根的意見。可是蒙斯克固執己見，他已下定決心，要讓這整個星區的命運，或是統治，或是滅亡。聽完副官的重述，雷諾不敢相信如此重要的秘密居然落到了他手里，光用這個就能夠讓蒙斯克無法翻身。
第十二章：越獄
任務簡報：托許想讓我們幫他攻下紐佛森監獄，他說里面關着的都是反對蒙斯克的人。只要放出那些囚犯，將會帶給蒙斯克一個大麻煩。
托許離開後，我們收到了一條高度加密的信息，一位漂亮的女特工想與雷諾談一談。她叫諾娃，雷諾說她是蒙斯克的人，沒什麼好談的。諾娃則直接切入主題：托許在騙我們。雷諾立刻把托許也接入了談話，反正他在偷聽。托許一來就不打算隱瞞，他說這次其實是要去救出他的幽魂特工，因為他們才是未來的主流。諾娃不接受，她抓到過很多幽魂，幾乎都是些喪心病狂的殺人魔，關在紐佛森監獄中的正是他們。托許連忙以幫助我們對抗蒙斯克作為條件，諾娃建議雷諾好好考慮一下，是否該把這些殺人狂放回宇宙中。誒，一邊是危險的盟友，一邊是蒙斯克的走狗，雷諾陷入了兩難的抉擇。
選擇之一：幫助托許
新增單位：幽魂
主要目標一：摧毀主要監獄基地
主要目標二：不能讓托許陣亡
可選目標一：消滅A區監獄守衛
可選目標二：消滅B區監獄守衛
資金獎勵：125000
任務獎勵：50000
成就：
越獄：在達成所有任務目標的情況下完成任務《越獄》
冷血殺手托許：在托許的生命值未低於100點的情況下完成普通難度的任務
監獄暴動：在25分鍾內完成困難難度的任務
雷諾覺得寧可信任老盟友，也不信任蒙斯克的人。托許得到了滿意的答復，他立即調出情報畫面，開始與雷諾討論戰術。諾娃肯定透露了消息，監獄的戒備變得極其森嚴，硬闖是行不通的。托許決定親身赴險，為我方大軍尋找突破口。此外，敏銳的麥特發現了兩個關滿戰俘的囚房，只需把牢門破壞就可以為我方增加士兵。托許為這一刻已經等了很久，行動吧。
作為這次的領頭人，我們還是頭一次見識托許的實力，他神不知鬼不覺地幹掉了大門守衛，這全仰仗於幽魂的強大能力——永久隱形與心靈震爆。剛進門托許就發現了不對勁，原來自治聯盟設置了飛彈炮台，這玩意可以探測到隱形單位。可這難不倒托許，他巧妙的控制距離，用心靈震爆一下震暈炮台旁的敵人，然後再逐個擊殺，十分冷酷無情。過了這一關，後面仍然有炮台存在，更有擺好架勢的攻城坦克，如果托許進入探測范圍，只會被轟成肉渣。他再次亮出一個法寶——幽能護甲，能夠替使用者吸收大量傷害，托許靠着它完全制服了坦克。此時他前方出現了更強大的守備力，雷諾讓我們過去支援他，兄弟們全速飛奔過去，必須給他提供足夠的火力掩護。托許帶領我們毀了一個兵營，他的能量因此耗盡了，他說自己可以用吞噬技能迅速補充能量，不過需要弟兄們提供一點鮮血，雖然沒有很痛，但這嗜血的傢伙真令人覺得惡心。
後來我們攻到了A區監獄，托許單獨進去搞定了守衛，囚犯們被放了出來，他們搶來一些帝國響尾蛇加入了行動。摧毀一個軍工廠後，前面就是B區監獄了。這里有一架渡鴉在巡邏，對托許來說它是個大麻煩，費了好一番功夫，他才釋放了B區囚犯，監獄這有些攻城坦克可以供犯人們使用。來到敵人主基地前，為了對付由雷神領頭的強大守衛，雷諾給托許准備了核彈。不出片刻，戒備森嚴的基地就被鏟平了，托許的幽魂們終於重見天日。
我們用一個下午的時間，就做到了別人50年都無法做到的事，這讓麥特無法置信。托許突然出現，承諾會一直幫我們打到蒙斯克完蛋為止，可麥特考慮的是人類更美好的未來。托許對此嗤之以鼻，蒙斯克這樣的人永遠都死不絕。既然這樣，雷諾對托許的戰鬥理由有點好奇，原來他純粹只是想找蒙斯克復仇而已。麥特是為了自由才起身戰鬥，他覺得這場革命根本與仇恨無關。隨後雷諾對麥特說了句意味深長的話：「你將看到那更美好的未來，但我們可就不一定了。」
選擇之二：幫助諾娃
新增單位：幽靈特工
主要目標一：摧毀朱磷貯存庫
主要目標二：摧毀態化氫瓦斯槽
主要目標三：摧毀幽能灌輸器
主要目標四：不能讓諾娃陣亡
可選目標：消滅所有幽魂特工
資金獎勵：125000
任務獎勵：50000
成就：
鬼使神差：在達成所有任務目標的情況下完成任務《鬼使神差》
支配戰法：在你控制的單位擊殺了15個地方部隊的情況下完成普通難度的任務
完全質子轉換：在困難難度任務中擊殺全部敵方單位
雷諾想清楚了，不能放任托許與他的那些殺人狂，否則他可能會成為第二個蒙斯克。諾娃暫時成為了我們的合作對象，她向雷諾說明了托許的所有設施，我們需要破壞3個重要設備——朱磷貯存庫、態化氫瓦斯槽、幽能灌輸器。諾娃說她可以幫我們攻破大部分防禦，但托許的基地經過了特別布防，沒人能夠單獨潛入。我們得給她派出支援，相互合作，而托許就留到最後交給她處理吧。
諾娃用核彈幫我們清出了一個降落區，解決前面的碉堡後，有一道閘門擋住了去路，雷諾只得拜託諾娃去另一側打開閘門控制器。她展現出高超的隱形與狙擊技巧，無聲無息地幹掉了守衛。盡管如此，她還是被困在了一個山崖下，托許在崖上部署了飛彈炮台，專門用來防備諾娃這樣的特工。這回輪到她求助了，我們沖上山崖幫她解除了妨礙，她則替我們打通了前進的道路。過了會，諾娃發現不遠處有一輛攻城坦克，她讓我們先別靠近，然後用心靈感應支配了駕駛員，坦克現在為我們所用了。利用坦克的攻城模式，我們順利到達了朱磷貯存庫下方，諾娃通過幽能探測器發現兩旁高台上埋伏着幽魂，她親自前去處理了他們。貯存庫門前有飛彈炮台與強大的戰巡艦守護着，不能正面硬碰。我們先讓坦克轟掉了左側炮台，然後由諾娃隱形上去破壞了貯存庫。
下個目標是態化氫瓦斯槽，諾娃先行降落到這一區，但她的行動好象被發現了，敵方派出渡鴉前來巡邏，諾娃只有保持好距離，利用狙擊把守衛逐個幹掉。清理出降落區後，我方死神部隊登場，伴隨着攻城坦克與本方渡鴉。死神們跳過閘門打開了道路，諾娃隨後帶着坦克向前進軍，渡鴉則順利完成了偵察工作。他們合作無間，攻克了敵人設下的每一個關卡，值得一提的是，渡鴉在西邊浮島上炸死一個幽魂，沒想到這玩意的威力如此驚人。諾娃來到瓦斯槽附近時，托許效仿歐蘭送來一份大禮——核彈，不過躲開它沒什麼難度。之後渡鴉探查到核彈發射井就在高台上，諾娃上去侵入發射系統，給托許的瓦斯槽也回了一份大禮。
輪到最後的幽能灌輸器了，這次由空中部隊為諾娃護航，維京戰機與女妖轟炸機無往不利，成功清掃了前進道路。諾娃在南面發現了一道堅實的柵欄，里邊一定有什麼東西。打開柵欄後只聽見一聲巨大咆哮，一隻雷獸沖了出來，蟲族的終極士兵怎麼會在這里？還好它沒發現諾娃，而是徑直向前沖去，路上的敵人都慘遭大卸八塊。諾娃循着這條血路走去，沒想到又出現一個驚喜——雷神機甲，這絕對是托許從帝國那偷來的。諾娃意識到這個大殺器能幫上大忙，立即用支配技能控制了它，之後他們輕松幹掉了北面的守衛。托許大概氣瘋了，又投下一顆核彈，避開爆炸後，諾娃占領了核彈發射井。正如雷諾所說，要攻破如此嚴密的看守，用核彈最省事。
托許失敗後，很快就按捺不住，發來通訊說要讓我們付出代價。只見他拿出一個巫毒玩偶，用匕首狠狠扎了一下，酒館那邊立馬傳來一聲哀號，是老泰科斯的聲音，看樣子是中了托許的某種咒術，不過沒大礙。托許說大家都是為達目的不擇手段的人，雷諾並不這麼看自己，他說托許再也沒有機會了。托許一點不緊張，相差6光年的距離讓他感到很安全，還問雷諾能拿他怎麼樣。話音剛落，可悲的托許便倒在了熒屏前。是諾娃，既快速又冷血，她讓雷諾想起了一個舊識，雷諾很慶幸自己並不是暗殺目標，諾娃說這只是暫時的。這件事結束後，我們收到了諾娃提供的幽靈特工訓練法，不知她是否會被蒙斯克發現，不過銷聲匿跡對她而言應該只是小事一樁。
第十三章：毀滅巨神
任務簡報：我們要想辦法把蒙斯克的罪行散播出去，傭兵米拉給了個建議：先從自治聯盟手中奪取一台叫做「奧丁」的戰爭機器，用它攻取UNN電台，然後廣播出聯邦副官所記錄的證據。我們可以在瓦爾哈拉行星的測試設施里找到奧丁。
新增單位：亡靈戰機
主要目標一：護送泰科斯奪取奧丁
主要目標二：不能讓泰科斯陣亡
主要目標三：摧毀所有帝國基地
主要目標四：不能讓奧丁被毀
可選目標一：找到吞噬者機體組織樣本
可選目標二：摧毀火神號
資金獎勵：120000
蟲族研發：+3
成就：
毀滅巨神：在完成所有任務目標的情況下完成任務《毀滅巨神》
誅神之刻：在普通難度的任務中摧毀洛奇
末日來也：在困難難度的任務中奧丁所受傷害不得超過其生命的30%
為了執行偷取奧丁的任務，我們來到了瓦爾哈拉。泰科斯有點令人擔心，他從來不會偷偷摸摸行動，我們得跟上他才行。麥特說如果不想要消息外泄，就必須摧毀這里所有的自治聯盟基地。雷諾想更多了解奧丁，麥特解釋道：「奧丁是一台實驗性的超重型攻城機器，能夠長期在前線作戰。」這下雷諾放心了，原來他擔心老泰科斯會不小心弄壞它。
行動開始，泰科斯一來就橫沖直撞的，我們只得緊緊跟在後邊掩護他。路旁有一個培養皿，斯特曼說這是某種蟲族樣本，讓我們給他帶點回去。這里的守衛根本經不住老泰科斯的蹂虐，我們三兩下就沖到了奧丁面前。哇塞，從沒見過那麼酷的東西，泰科斯已經等不及了，雷諾讓他守在原地，但只見他駕着奧丁轟掉大門，獨自沖了出去。麥特發現泰科斯的通訊出了問題，已經聽不到命令了。雷諾只有趕緊讓我們把基地架好，在他變瘋狂之前得跟住他。不一會，麥特發現有戰巡艦正攻過來，光靠陸戰隊是無法應付的，史汪得知後馬上送了幾架亡靈戰機過來，它們能夠同時打擊空中與地面部隊。敵艦被毀後，泰科斯要去西北邊的帝國基地尋找樂子，我們不得不跟上這任性的傢伙。之後他又要求工程車過來修理奧丁，還一直喋喋不休的，真是受不了。
休息了片刻，泰科斯又按捺不住了，北邊的帝國基地是他下一個目標。這次我們倒落得輕松，泰科斯完全在狂轟亂炸。接下來的行動也很順利，又有2個帝國基地被夷為平地。後來當亡靈戰機巡邏到東邊時，發現一艘強大的「火神號」敵艦，留着只會後患無窮，亡靈戰機針對它無法偵測隱形單位的弱點，輕而易舉地擊毀了它。現在敵人只剩下最後一座基地了，但麥特查探到一個棘手的情況，那里有不少戰巡艦守護着。為了保住奧丁，雷諾讓我們召集所有亡靈戰機來護航。最後的激戰開始了，這個基地的防守很堅固，我們費了九牛二虎之力才突破到敵人指揮部。泰科斯按下一個骷髏按鈕，投出了一枚小型核彈。隨着一聲巨響，眼前被炸成一個大坑。大家為這次勝利喝彩，因為我們的第一步計劃成功了！
回去後大夥都在酒館慶祝，我們還是頭一次聽到雷諾對泰科斯如此贊賞，是恐懼與暴力讓泰科斯表現出了最好的一面，他倆真是最佳搭檔。
第十四章：驚爆內幕
任務簡報：這次的行動是攻占UNN電台，我們可以好好利用奧丁來解決防禦工事，之後就要把蒙斯克的罪行廣布天下。這件事將會造成好幾年的嚴重影響。
新增單位：雷神
主要目標一：在突襲時摧毀帝國基地
主要目標二：控制所有廣播塔
資金獎勵：120000
成就：
驚爆內幕：在完成所有任務目標的情況下完成任務《驚爆內幕》
巡皆殲滅：在普通難度的任務中，進行偷襲行動時消滅兵營、重工、機場各一座
閃電戰：在20分鍾內完成困難難度的任務
上回的行動很成功，自治聯盟並沒發現我們偷了奧丁。不知用了什麼辦法，麥特居然讓泰科斯老老實實藏在了奧丁里，這真是個奇跡。對麥特來說，揭露蒙斯克是目前最重要的，所以不論任何事他都會盡全力。自治聯盟打算在克哈星上展示奧丁，對於這種引狼入室的行為他們毫不知情，而我們可以趁亂把基地偷偷架在附近。泰科斯破壞得越多，對雷諾的計劃也就越有利。不過帝國並不是省油的燈，我們必須做好一切准備。
行動開始，麥特首先侵入了帝國的安全網絡系統，敵方基地的位置被我們一覽無余。緊接着雷諾令奧丁開始突襲，老泰科斯早已等得不耐煩了。自治聯盟對於奧丁的反叛非常吃驚，人群紛紛倉皇逃竄。帝國的沃菲爾將軍親自出面了，嚴令泰科斯投降，鬼才會聽他的。周圍的敵人似乎還搞不清狀況，奧丁都打到眼前了才反應過來。這種混亂局面正是泰科斯的最愛，他趁着這幾分鍾把敵人的基地搞得一團糟，為麥特爭取了不少時間， UNN的網絡許可到手了。我們只需派人去控制廣播塔，就能把蒙斯克的罪證傳至自治聯盟的每個角落。
帝國現在有了防備，我們不能貿然進攻，必須先訓練出軍隊。史汪仿照奧丁造出了雷神機甲，雖有些小巧，但威力巨大。軍隊備齊後，我們攻向了1號廣播塔，有奧丁和雷神這樣的戰爭機器在，打起來一點不費事。掃平敵軍後我們開始上傳數據，沃菲爾派出了一支「阿爾發」突擊小隊來阻止我們，但沒能成功。第一份上傳完畢，這時蒙斯克識破了我們的身份，他氣憤萬千，揚言要拿到雷諾的人頭。我們上傳第二份數據時，沃菲爾又派了一隊「刺客」過來送死，真是自不量力。攻到最後的3號廣播塔時，有人在塔的南邊發現一所科學設施，這一定是為帝國做科研的地方。摧毀科學設施後，我們從廢墟中翻出一本機密檔案，先拿回去再說。沃菲爾後來派出了「查理」突擊隊，但仍然不能阻止我們把消息散播到全世界。不出一會，我們特製的UNN的特別快報已經在世界各地播放，人民們對此十分憤怒，有的人開始公然反抗自治聯盟，這下可有好戲看了。
接下來的幾天，媒體一直在火熱討論蒙斯克的罪行。老傢伙終於忍不住了，他舉辦了一場記者招待會，不過進行得很不順利，我們真高興看到蒙斯克這副不安的模樣。雷諾深怕自治聯盟會像以前一樣編個故事蒙騙過去，麥特說這次絕不會了，因為自治聯盟以往都是把媒體作為宣傳武器，可媒體是一把雙刃劍，蒙斯克這次肯定要栽跟頭了。雷諾聽得有理，他覺得麥特才是我們未來的領導人。最後他倆難掩心中高興，一同開懷而笑。
第十五章：一探究竟（隱藏任務）
進入條件：取得第十四章驚爆內幕中的機密文件，文件位於地圖東南角的科學設施里，使用強制攻擊打掉建築既可發現。
任務簡報：拿回來的機密檔案上顯示，自治聯盟有一間最高機密的生化武器實驗室，位於卡司塔那的軌道平台上，麥特讓我們過去看看帝國到底在搞什麼鬼。
主要目標一：調查帝國實驗室
主要目標二：摧毀核聚變反應爐
主要目標三：撤離研究所
主要目標四：不能讓雷諾陣亡
可選目標一：找到星靈聖物
可選目標二：消滅殘暴蟲
資金獎勵：125000
神族研發：+4
蟲族研發：+3
成就：
一探究竟：在達成所有任務目標的情況下完成任務《一探究竟》
沒那麼殘暴：在不讓殘暴蟲擊殺任何單位的情況下完成普通難度的任務
蓄勢待發：在困難難度的任務中找出共13個武器拾起地點
這個秘密實驗室建在一顆隕石上，它的對外身份是貝里利姆倉儲企業。呵，我們可不是來搶貝里利姆的。雷諾想更多的了解機密文件所記載的秘密，但唯一能知道只有實驗室的安全密碼，看來只能親自出馬了。
我們隨雷諾長官降落在了平台上，麥特說一定要小心行事，雷諾顯得很有自信：「[謹慎]是我的小名。」行動開始，雷諾用穿透炸藥直接炸飛了大門，進門後我們首先就看到一台安保監視器，畫面顯示隔壁房間已有所防備。雷諾讓副官把安全系統控制，啟動地獄火炮台，讓敵人嘗嘗自家的火焰。來到第二個房間，雷諾對培養皿中的特殊蟲族有點興趣，麥特進行了掃描，結果發現里面同時包含蟲族與神族的DNA，該不會是被同化了吧。正討論着，房間前後的大門突然關上，自治聯盟把實驗圍欄中的蟲群放了出來，我們只得做困獸之鬥。沖出房間後，雷諾拾獲了幾顆手榴彈，他用這玩意解決了走廊上的敵人。走廊盡頭的監視器顯示隔壁房間關有很多實驗生物，我們選擇釋放了65隻跳蟲，看着它們與守衛同歸於盡真是爽。這個房間仍然存有特殊的蟲族標本，斯特曼通過實驗發現：有人對這些蟲族的DNA進行了人工嫁接。天知道自治聯盟想做出什麼來，雷諾決定要阻止這個瘋狂的實驗，把這里炸上天應該是最佳辦法。麥特偵測到附近有一個很強的能量訊號，應該是核聚變反應爐，如果讓它爆炸就能牽連整個實驗室，然後就可以閃人了。出了房間後，右側有一道被封鎖的大門，里面藏着一把實驗性等離子炮，雷諾決定就地試驗一下。後來我們在一個大貨運區前碰上了麻煩，這里有重型單位駐守。正當雷諾用監視器查看敵情時，卻意外發現了某種未啟動的戰鬥機器人，好象是叫做戰神，雷諾讓它變成了幫手，帶我們順利通過了貨運區。誰知道麻煩之後還有更大的麻煩，前方監視器顯示，下個房間中關着一條殘暴蟲。上次見到它還是在紅石星球呢，這傢伙比雷獸更棘手，保險起見，雷諾令麥特送來了一支援軍。攻占房間後，我們找到了禁錮殘暴蟲的控制台，麥特說現在並不是對抗它的好時機，不過斯特曼的實驗會用到它的樣本。雷諾考慮了片刻，決定幹掉殘暴蟲，正好試試等離子炮的威力。這場血戰讓我們失去了一位夥伴，殘暴蟲則被雷諾轟出了一個大窟窿。來到最末尾的房間，麥特說能量訊號已經近在咫尺，反應爐就在這里，大家奉命摧毀了它。本以為能順利閃人了，但副官突然發來緊急報告，房間中央設施里關着的竟然是神族與蟲族的混源體！自治聯盟一直是利用反應爐的能量來維持封鎖力場，現在反應爐毀了，再也沒人能夠阻止它。混源體沖破牢籠後展現了驚人的戰鬥力，雷諾意識到我們敵不過它，決定立刻撤退。我的老天爺，蒙斯克想要毀滅世界嗎？
整個實驗室已經被反應爐的爆炸影響到，照明系統損壞了，我們只有利用手電筒與周圍的火焰來看路。最要命的是混源體已經不知所蹤，保不准會在哪突然冒出來。一路上有很多逃出牢籠的怪物四處作亂，我們只能盡量避開，迅速撤離。雷諾在地上發現一個時空裂縫裝置，這是外星科技，但現在誰管這麼多，帶上總會有用的。前面有一堆殘骸擋住去路，為了爭取時間，雷諾用等離子炮一下就炸開了。剛走出沒兩步，我們發現了混源體，幸運的是它正被一堆殘骸擋住，我們何不宰了它呢？麥特很專業的回答了這個問題：「混源體是無敵的！」真該死，那殘害撐不了多久，趕緊跑吧。路上我們又發現一台戰神，幸運女神保佑，希望它能夠多抵擋一陣。好不容易跑出一段路，背後竟又出現了混源體的身影，可惡，快逃啊！機警的雷諾還用時空裂縫稍微延緩了混源體的行動。跑着跑着，混源體忽然不見蹤影，它從麥特的掃描器上消失了，就算這樣我們也不能放鬆警惕。前面房間有蟲毯蔓延出來，里邊有很多蟲卵與雷獸幼蟲，一頭成年雷獸在我們殺進去時沖了進來，看樣子它是想保護蟲卵，但我們是不會手軟的。突破剛才的房間後，混源體居然憑空出現，這天殺的還真難纏啊。雷諾再次使用時空裂縫拖住了它，大家跑到門口時發現自治聯盟的士兵也在撤退，嘴里還提到運輸機什麼的。運輸機？雷諾有辦法了，我們以最快的速度沖了出去，然後坐着自治聯盟「好心提供」的運輸機回家了。
雷諾與麥特討論了一下這次調查，不知道蒙斯克是怎麼做到的，可他正在創造自己的外星超級戰士。帝國好象還沒完全搞定這項研究，但蒙斯克肯定不止這一間實驗室，誰知道他還會再搞出什麼鬼名堂。
第十六章：挖掘行動
任務簡報：泰科斯的莫比斯朋友有了新任務給我們，他們的一支專家隊伍在荒涼的錫爾行星尋找神器，而這支隊伍在2天前失去聯絡了，肯定是遇到了什麼危險。
新增單位：攻城坦克
主要目標一：獲取雷射鑽
主要目標二：摧毀神廟大門
主要目標三：雷射鑽不能被摧毀
可選目標：尋獲星靈聖物
資金獎勵：120000
神族研發：+3
成就：
挖掘行動：在達成所有任務目標的情況下完成任務《挖掘行動》
鑽頭王者：在普通難度的任務中用鐳射鑽孔機擊殺20名敵方單位
真爽：在困難難度任務中摧毀50個神族建築物
泰科斯形容我們要去的地方是個停屍間，以前住在這的生物已經死去上百萬年。失蹤的專家小組曾帶了一個超大的雷射鑽，並在散發出神器輻射之處鑽了一條路。雷諾很驚訝，莫比斯連如此強大的武器都有，那會是什麼東西讓他們失蹤的呢？
登陸後，我們得先查清是什麼把這里清空了，但卻有人先找上門來，是塔達力姆，看樣子探險隊是觸犯了他們的神聖才慘遭全滅。來到一個轉角時，雷諾嚴令我們停下，原來對面有好幾座神族的加農炮，他讓史汪送來了之前答應好的攻城坦克，在坦克的攻城模式下，加農炮一個不剩，後來在山谷遇到的追獵者也被轟了個稀巴爛。走出山谷後終於看到了莫比斯的基地，副官解除了安全密碼，把基地全權交給了我方。泰科斯猴急地操控起雷射鑽，對准了神廟火力全開，雖然雷射鑽威力巨大，但不花點時間可弄不開神廟的大門。塔達力姆立刻出動了部隊，雷諾讓我們好好利用碉堡和坦克布下防禦，必須堅守到鑽洞完成為止。
麥特把莫比斯對這個地區的探測訊息發了過來，這樣我們就能稍微了解塔達力姆的動向了。前幾波進攻失敗後，塔達力姆出動了執行官，這些傢伙是一團強大的幽能體，平常很難應付，不過雷諾想到了用雷射來阻擋他們。當泰科斯鑽破大門的最外層時，有幾艘神族運輸船飛了過來，上面載着滿滿的士兵，他們想突襲！雷諾馬上就識破了此計，令我們把運輸船擊落了。麥特隨後探測到一些星靈聖物藏在附近的聖殿里，得想辦法把它們帶給斯特曼，我們首先想到了維京戰機，它們的空陸雙形態正好適合這個任務：先懸在聖殿附近讓泰科斯知道正確位置，然後用雷射把聖殿掃平，最後着陸拾取，非常完美的行動。隨着雷射對神廟的破壞越來越嚴重，塔達力姆徹底被激怒了，他們派出了終極部隊——巨像，這是一種非常高大的機械，擁有可跨越山脈的長腿，再加上橫向掃射的熱能割裂槍，完全是步兵的末日。但它有一個致命缺點——太過高大，這會導致它很容易被維京等對空戰機攻擊到。對，就是維京，我們召集了一隊維京過來，配合上坦克的嚴密防守，巨像幾乎無法靠近。塔達力姆的底牌都打光了，我們的雷射鑽順利在神廟上鑽出一條通道，神器到手。後來塔達力姆執行官對雷諾發出了全面通緝，而泰科斯只在意錢的多少，希望這別是條不歸路。
某天，雷諾獨自走在戰艦的一個通道里，一名黑暗聖堂武士突然出現，竟然是澤拉圖，他是雷諾的舊識了。此行他帶來一段末日預言，還有一些神秘莫測的話語，他相信只有雷諾與凱莉根才能拯救世界。雷諾感覺很不可思議，擇拉圖一把抓住他的手，交出了一塊水晶，然後就消失了。雷諾把水晶放到了實驗室，想起以前聽說過這叫伊翰水晶，可以從中看到別人的回憶，看來澤拉圖是想讓雷諾了解自己所經歷的一切。
第十七章：末日之呢喃
任務簡報：雷諾通過伊翰水晶看到了澤拉圖留給他的信息，擇拉圖把自身的記憶與本質都注入到水晶中了，希望全寄託在雷諾身上。
主要目標一：將澤拉圖帶到每個薩爾納加聖殿
主要目標二：不能讓澤拉圖陣亡
可選目標：摧毀蟲族孵化所
神族研發：+3
蟲族研發：+3
成就：
末日之呢喃：在完成所有任務目標的情況下完成任務《末日之呢喃》
追獵者派對：在保存3個以上追獵者的情況下完成普通難度的任務
毫發無傷：在澤拉圖未受到生命值傷害的情況下完成困難難度的任務
雷諾正在看澤拉圖的經歷，自從他們上次共同對抗蟲族之後，澤拉圖一直在尋找一個關於薩爾納加回歸的古老預言。他來到一個偏僻的星球烏蘭，在這發現一塊記錄了預言片段的古老石板。不論是蟲群的到來，還是神族首先起身對抗蟲族，全都刻在上面。更有一段令澤拉圖在意的文字：創造神族的薩爾納加將要返回這個世界。神的回歸將帶來什麼，拯救或毀滅？澤拉圖正在思考時突然聽到背後有動靜，他小心翼翼地過去探查。走到亂石間，蟲族悄然出現，澤拉圖行雲流水間便斬殺了數頭刺蛇。這時忽然傳來一陣笑聲，刀鋒女皇從陰影中走出，她早就預料到澤拉圖會來，一直靜靜的等在這里。凱莉根從預言中看到了毀滅，想要告訴澤拉圖某些信息，但處理眼前最大威脅才是澤拉圖的第一反應。一場較量之後，雙方各有損傷，凱莉根告訴他這是毫無意義的戰鬥，一同對抗毀滅才是他們應該做的。可澤拉圖不相信預言所寫的是絕對毀滅，總是會有希望的。
烏蘭的各個聖殿中都保存着預言的碎片，澤拉圖決定盡快取得它們然後離開這里。他發現蟲族已經遍布此地，但作為一個強大的黑暗聖堂武士，隱身行動是他的看家本領。越過幾道裂縫與障礙後，澤拉圖發現了孢子爬行蟲，隱形是騙不過這怪物的，只有用虛空牢獄把它禁錮起來，然後迅速幹掉它。幾經波折，他終於看到了第一個聖殿，但是前方有一條大裂縫，上方還有一隻監察王蟲在空中巡邏，它也能夠探測隱形，如果貿然穿越過去，只會遭到刺蛇的攻擊。可澤拉圖的攻擊無法觸及天空，看來只能在禁錮王蟲時盡快解決地面的威脅。之後他順利取得了第1塊預言碎片，但有個不祥的預感一直壓在他心頭，必須趕在凱莉根改變心意前取得剩下的碎片。在一片空地前，凱莉根同時派出了監察王蟲與飛龍，澤拉圖不知該如何是好，可突然有什麼東西傳躍過來，是追獵者！他們奉命前來幫助澤拉圖，有一位高階聖堂武士卡拉斯正在附近。澤拉圖很高興有同伴加入，他帶領追獵者殺到了一個蟲族孵化所前，看到凱莉根如此玷污這個神聖的世界，他決心要把所有的孵化所都毀掉。掃平眼前的孵化所後，澤拉圖來到了第2個聖殿，凱莉根嘲笑他居然把幻想當希望，但他說就算只有一絲希望也不會放棄。
突破了重重困難，澤拉圖終於接近最後一個聖殿，他與卡拉斯在這不期而遇，原來卡拉斯的部隊是追蹤刀鋒女皇來到這兒，他想知道凱莉根在尋找什麼。澤拉圖把原委告訴了他，刀鋒女皇是被預言吸引過來的，不能讓她捷足先登。卡拉斯很樂意幫忙，面對眼前的蟲族大軍，他毫無俱色，帶着部隊沖殺過去。狂熱者切開了每一個蟲族的胸膛，追獵者則擊穿了所有空中怪物，殺到最後已經沒有活着的蟲族了。澤拉圖成功拿到了所有碎片，預言中提到一個將會「打破神之循環」的人，卡拉斯覺得這是個不好的預兆。正說着，刀鋒女皇已經出現在他們眼前，她又召來了無數蟲群，想要將毀滅帶給他們。卡拉斯知道目前已經寡不敵眾，決定留下來拖住凱莉根，他叫澤拉圖帶着預言快逃，去揭開其中的秘密，這會關繫到神族的未來。澤拉圖被卡拉斯的精神所感動，決心保住預言，他帶着幾個追獵者迅速逃往了虛空追尋者飛船，但蟲群已經埋伏在路上，他們邊戰邊退，最後只有澤拉圖活着離開了。
澤拉圖無法自己解讀出預言，他想到了扎庫的守護者們，他們的智慧是這個銀河唯一剩下的希望了。
第十八章：邪惡轉捩點
任務簡報：澤拉圖召集了盟軍與他一同前往扎庫，那里的三位神秘守護者正在等待着。同時，潛伏在黑暗中的某個東西看到了這一切。
主要目標一：啟用廢棄的基地
主要目標二：解救守護者
可選目標：啟動廢棄的建築
神族研發：+3
蟲族研發：+3
成就：
邪惡轉折點：在達成所有任務目標的情況下完成任務《邪惡轉折點》
出於正義：在普通難度的任務中消滅所有神族
死亡筆記：在25分鍾內完成困難難度的任務《邪惡轉折點》
扎庫行星是神族的文庫禁地，這里的遠古知識由三名不朽守護者看管着，守護者們能夠翻譯出所有預言，澤拉圖正在努力尋找他們。
來到文庫禁地，澤拉圖發現一座神族基地，但這里出奇的安靜，沒有任何人的蹤影。所幸建築物都還算完好，他帶來的探測器能夠做一些採集和躍傳的工作。首先躍傳2個水晶塔來給建築群提供能量，這樣就可以控制整座基地了。當澤拉圖正在專心訓練部隊時，有一個被腐化的追獵者傳來口信：「守護者已經臣服於一個更強大的力量了。」澤拉圖立刻感應到守護者的靈魂已經被囚禁了，肯定是某種邪惡力量做的。他還感應到附近有幾座廢棄建築，只需給它們提供能量就能喚來援軍。
不久後，一股強大的黑暗之力出現在遠處，是混源體，雷諾之前也有碰到過這樣的傢伙。澤拉圖實在不敢相信眼前這個污穢的存在，混源體正在吸收守護者的能量，他必須要盡早救出守護者。混源體的名字叫瑪爾，他想要拆了澤拉圖的基地，他確實很強大，但是還比不上雷諾在帝國實驗室遇到的那個，澤拉圖的部隊勉強擊退了他。可混源體的聲音瞬間又傳了過來，原來他在吸收守護者的能量，等力量恢復又會不斷進攻，這樣周而復始，澤拉圖只能暫時先頂着。直到部隊成型後，他率軍掃平了東南方的腐化神族，隨後啟動了這里的聖堂文庫，文庫里的高階聖堂武士回應了澤拉圖的召喚，起身為他而戰。現在的軍隊規模完全可以壓制混源體，澤拉圖令大軍沖向了守護者牢籠，軍隊氣勢如虹，無人能擋，混源體也被他們踩在腳下。澤拉圖趁瑪爾恢復之前打碎了牢籠，終於救出守護者。
守護者們拿到澤拉圖帶來的預言碎片，用遠古文庫解開了整段預言，其中提到了「飢餓者」，這是澤拉圖之前不知的。那麼誰是飢餓者呢，難道是指主宰嗎？澤拉圖在思慮中想到了他的家鄉——艾爾，同時也是主宰安息的地方，他決定回去調查一下。
第十九章：未來的回音
任務簡報：澤拉圖回到了神族的母星艾爾，這里絕大部分土地已經被蟲族的污染所覆蓋，他此行只為了調查殘留在這里的主宰屍骸。
主要目標一：找到星核
主要目標二：把澤拉圖帶到主宰觸角處
主要目標三：不能讓澤拉圖陣亡
可選目標：啟動方尖碑
神族研發：+2
蟲族研發：+4
成就：
未來的回音：在達成所有任務目標的情況下完成任務《未來的回音》
萬夫莫敵：在澤拉圖擊殺50隻蟲族的情況下完成普通難度的任務
主宰之屍：在20分鍾內完成困難難度的任務
蟲族主宰由於太過自信而葬身於艾爾，但它腐爛的屍體中還遺留着記憶電波，澤拉圖想要通過與它的巨型觸角連結來一窺它的秘密，不過此地的蟲族爪牙將會成為阻礙。
登陸後，澤拉圖要做的第一件事就是找一個據點，這樣才能召喚援軍壓制蟲族。動身後，他發現一個忠心的觀察者，從神族撤退以來它就一直在此監視，蟲族就算鑽到地底也難逃它的法眼。在觀察者的引領下，澤拉圖來到一個廢棄基地，星核還存有些許能量，他把星核喚醒，然後讓探測器開始工作。澤拉圖的召喚同時還吸引了某種龐然大物，它們從深海中走了出來，原來是神族的偉大守護者——巨像。觀察者發現蟲族已經埋伏在主宰的觸角旁，並且正在另一邊組織進攻，想要除掉對主宰產生威脅的所有人。澤拉圖只得加緊腳步，隻身攻向了蟲族最薄弱的防守區，並在這里接觸了主宰的第一根觸角，他感受到了痛苦、驚恐與死亡。隨後他讓探測器啟動了附近的空間之門與方尖碑，一些追獵者與高階聖堂武士被放了出來。這時蟲族對基地發動了一波狂暴的攻擊，雖說基地有巨像防守，但澤拉圖還是放心不下，他立刻令剛加入的新兵們回去幫忙。
巨像在高地上不斷發射着割裂槍，加上追獵者與加農炮的火力，最終撕碎了蟲群。剛才浪費了不少時間，澤拉圖立馬揮師東進，盪平了沿途所有蟲族，然後他從主宰的第二根觸角中感受到了死亡和快樂。後來他一路宰了很多阻礙他的蟲族，成功接觸了第三根觸角，澤拉圖感受到主宰對於一個長久計劃的滿足，以及對未來的恐懼。只剩下最後一根觸角了，蟲族都變得瘋狂起來，但仍然無法阻止澤拉圖對預言真相的渴求，他在第四根觸角上感受到了一個結束。思來想去，澤拉圖始終無法把主宰的所有感受整理成一個明確的信息。
澤拉圖決定更靠近主宰的外皮質來理解它的想法，但卻意外遇到了塔薩達的幻影。在澤拉圖的記憶中，塔薩達為了消滅主宰而犧牲了自己，那他怎麼會出現在這里呢。塔薩達欲言又止，對於自己的犧牲並不想多解釋，他只想告訴澤拉圖一些關於主宰的故事：「蟲族已經成為變化體，最初它們只有一個單純的目標，那就是消**族。主宰誕生時被賦予了思考和學習的能力，但卻得不到自由意志，它在思想的監獄中不停地反抗着。從來沒有人知道是誰在幕後控制着主宰，後來主宰找到一個可以讓全體蟲族脫離控制的方法，那就是創造刀鋒女皇，只有她才能讓蟲族遠離奴隸的命運，並可阻止主宰所預見的未來。
第二十章：在黑暗深淵之中
任務簡報：澤拉圖看到了主宰預見的末日景象，所有種族都會滅亡，一切事物即將終結。如果凱莉根死亡，未來的命運就是如此。
主要目標一：消滅1500個蟲族
主要目標二：拚死戰至最後
可選目標：保護星靈文庫
神族研發：+3
蟲族研發：+3
成就：
在黑暗的深淵之中：在達成所有任務目標的情況下完成任務《在黑暗的深淵之中》
通往光榮的半途中：在普通難度的任務中，額外擊殺250隻蟲族單位
光榮戰死：在普通難度的任務中，額外擊殺750隻蟲族單位
在未來的世界里，蟲族淪為了混源體的奴隸，人類已經滅亡，而神族的所有英雄們將聚集在一個被暗影籠罩的星球上，率領大軍向邪惡發起最終戰役，直至最後一兵一卒。盡管如此，他們也終將全部滅亡。
在澤拉圖的召喚下，首先趕來的英雄是鄔盧爾上將，他帶領着叱咤天空的鳳凰戰機。神族的首要保護對象是星靈文庫，這是神族留給繼承者的遺產，他們在通向文庫的三個路口排滿了光子加農炮。蟲族在一個黑暗之聲的引導下發動了進攻，神族頑強抵抗，殺退了好幾波蟲群。後來混源體親自參戰，而強大的莫翰達與他的虛空艦隊也及時來援。蟲族似乎永遠殺不完，混源體好象也無法徹底消滅，它們不斷沖擊着神族最後的真理，雙方死傷無數，可邪惡仍然源源不絕的涌進聖地，神族的戰鬥越來越吃緊。在這棘手的情況下，執行官席倫蒂絲登場，一隊航空母艦為她而戰，澤拉圖終於舒了一口氣。
戰場上充滿了撕殺聲與咆哮聲，其中更夾雜着那個黑暗之聲，蟲族的攻勢隨之越來越猛，混源體的數量也越來越多。加農炮抵不住那麼猛烈的攻勢，已經全數被毀，澤拉圖的兄弟們也幾乎屍橫遍野，簡直到了絕望的時刻。但都這種時候了，神族最後1個英雄——亞坦尼斯大主教才姍姍來遲，原來他去招集了銀河中其餘的所有倖存者，現在他指揮着艾爾之盾趕來做最後一搏。艾爾之盾是神族的終極聖母艦，戰鬥力超群，無數蟲群都慘遭焚毀，但強弩之末不能穿魯縞，神族的滅亡終究無法改變。眼看神族走向了末日，黑暗之聲再次傳來，他說原本有一個人能夠破壞他的計劃，但是她被神族的莽撞消滅了，這個人就是刀鋒女皇！澤拉圖直到臨死前都不敢置信，能夠阻止毀滅的竟會是凱莉根！？戰爭結束後，黑暗之聲對於替他賣命的蟲群似乎沒有絲毫感情，蟲族也在此滅亡，宇宙被化做了一片黑暗。
雷諾看完了所有預言，得知了虛空幽能中的某個墮落者將給世界帶來毀滅，凱莉根是唯一能阻止毀滅的，而她的命運將由雷諾決定。澤拉圖給出了最後建議：「必須要讓凱莉根活着。」
第二十一章：莫比斯系數
任務簡報：刀鋒女皇已經推測出我們神器的買家，她令蟲群對泰拉朵VIII星球發起了攻擊，這里是莫比斯基金會的主要研究區，領頭的是那魯博士，他希望我們能確保所有神器研究文件的安全。
新增單位：醫療艇
主要目標一：摧毀所有數據核心
主要目標二：不能讓凱莉根侵入任何一個核心
可選目標：消滅殘暴蟲
資金獎勵：120000
蟲族研發：+3
成就：
莫比斯系數：在完成所有任務目標的情況下完成任務《莫比斯系數》
內有活口：在普通難度的任務中救出所有莫比斯基金會的生還者
硬漢：在卡列甘拆完6棟樓前完成困難難度的任務
雷諾與那魯博士聯絡上了，博士聽聞過雷諾作為警長時的名聲，相信自己一定會得到幫助，雷諾很爽快的答應了他。博士已經准備撤離，他希望我們趕在刀鋒女皇找到數據核心之前毀掉數據，這樣的話，剩餘神器的坐標就不會被蟲族得知。任務剛交代完，副官就偵測到一個12級幽能，雷諾知道，凱莉根已經抵達，我們得抓緊時間了。
副官分析了凱莉根對數據核心的搜索模式，看樣子她無法探知數據的准確位置，只是把出現在眼前的建築都搜索一遍，這會為我們爭取不少時間。凱莉根得知我們的到來後，與雷諾發生了一段有趣的嗆聲，他們倆真是知己知彼。那魯博士一開始就給我們派來了醫療艇和戰豬精英陸戰隊，這能幫我們渡過弱勢時期，簡直是雪中送炭。醫療艇除了治傷還能載人，兄弟們乘着它先趕往了最近的一個數據核心，到了那里，我們碰到了幾個莫比斯的士兵，他們加入行動，與我們一起毀掉了核心。凱莉根發現數據被搶先後有點生氣，雷諾叫我們別管她，快點去下一個核心處。其實凱莉根那邊也沒空理我們，不過她的蟲族部隊會代替她。一條地下蠕蟲出現在我們基地前，蟲群不斷從它的血盆大口鑽出來，我們只得先飛回去營救基地。消除險情後，我們讓工程車加強了基地防禦，攻城坦克、飛彈炮台、碉堡等等一應具有，我們這才放心地向第二個數據核心出發。
地面有很多孢子爬行蟲，它們對醫療艇是個巨大威脅，我們只得通過步行的方式慢慢推進。同時還要擔心刀鋒女皇會不會從後面追上來，所幸沒發生這樣的事，第二個核心也被我們順利拆除，現在還剩最後一個。途中，雷諾發現一頭殘暴蟲，它在一個孤立的平台上，對我們造不成威脅，但斯特曼想要拿它回去做研究，我們只得幫一下了。接下來所剩的時間不多了，我們急忙趕往最後一個核心。一些莫比斯士兵被困在了附近高樓上，救下他們可以增加我方戰力，醫療艇上因此多了幾名乘客。飛到最後這個核心時，我們心中暗喜，因為刀鋒女皇還沒出現。兄弟們趕緊下機，用最猛烈的炮火攻了進去，可憐的蟲族基地瞬間瓦解，隨後我們以最快的速度拆掉了核心，任務完成。該撤退了，雷諾問那魯博士：「為何凱莉根對這些神器那麼感興趣。」博士說這是因為她害怕神器的力量，如同害怕薩爾納加一樣。
這次任務之後，雷諾夢到了當年凱莉根在塔桑尼斯被拋棄的情景：在努力的戰鬥過後，她發現自己被遺棄了，臉上是那麼地哀傷，又是那麼地絕望，最終被席捲而來的蟲族給吞噬。雷諾猛然驚醒，碰倒了桌上的酒瓶，麥特給撿了起來。他很關心雷諾的近況，知道雷諾最近一直被關於凱莉根的夢魘所困擾，他說這不是雷諾的錯。雷諾讓他少管閒事，不想再聽這些陳腔濫調。麥特把一個東西交到雷諾手里，出門時忍不住轉身質問雷諾：「你知道自己現在變成什麼樣子了嗎？」雷諾說這是自己的選擇，麥特讓他好好想清楚目前該做的事，大傢伙都在等着他。後來雷諾翻開手里的東西一看，原來是自己當年的警徽。
第二十二章：超級新星
任務簡報：莫比斯被蟲族逼走後，在某處重新設立了一個據點，他們又發現了另一個神器的位置，正位於鈦風行星XI。
新增單位：女妖轟炸機
主要目標一：占領着陸區
主要目標二：摧毀神器陳列室
可選目標：找到星靈聖物
資金獎勵：120000
神族研發：+4
成就：
超級新星：在達成所有任務目標的情況下完成任務《超級新星》
閃邊涼快去：在不讓任何單位死於火牆的情況下完成普通難度的任務
震驚世人：在用隱匿女妖擊殺75個單位或建築的情況下完成困難難度的任務
海伯利昂號來到了鈦風行星附近，雷諾他們正在觀察星圖，但熒屏突然間被一片白光籠罩，儀器探測到此星系的恆星剛剛釋放了500%的能量，這表示這個恆星在幾小時內將會超新星爆發。目前恆星所釋放的能量已經把鈦風行星給燒着了，雷諾最討厭的就是火了，但此次任務偏偏得在火中進行。好消息是我們已經有足夠的資源儲備，不需要再建補給站了。神器被塔達力姆防守在最里面，我們必須趕在太陽爆炸前取得它，出發！。
首先得為基地尋找一個着陸區，史汪推薦由女妖轟炸機來完成這個任務，它們能夠對地發射火箭，還能隱形，確實是任務最佳人選。不出一會，女妖就找到了一個很好的着陸區，只要把這里的加農炮解決就完事。基地着陸後，副官探測到正有一股火浪正西邊燒來，我們要爭取在火浪到來前訓練出一支部隊，希爾的雇傭兵是個不錯的選擇。期間有塔達力姆的士兵過來騷擾，兄弟們得到了熱身。當火浪逼近時，麥特說東面有一個塔達力姆前哨站，只要除掉他們就能讓基地遷移過去，聽完我們全軍立刻壓上，輕易地奪取了這個據點。之後我們從周圍的聖壇帶回了幾個星靈聖物，這是斯特曼吩咐的。雖然有了新的據點，但火浪不會停止吞噬，我們必須趕在火燒屁股前找到下一個據點，然後清理出安全區。神器就放在東面的陳列室里，由兩座塔達力姆基地所守護，其中一座之後被我們夷為了平地。搬到了最新據點，兄弟們積極為最終一戰在做准備，只要沖破塔達力姆的防守，神器就到手了。最後一切順利，我們拿到了神器。撤離時從地面傳來一聲塔達力姆執行官的怒吼，看來雷諾真要變成他們的眼中釘了。
交貨時間已到，但卻遲遲不見莫比斯的人影，雷諾覺得很詭異。剛說完就出現了異常情況，幾艘自治聯盟的戰艦突然跳躍到附近，帶頭的正是蒙斯克的旗艦。麥特有一種不祥的預感，擔心這是陷阱，但雷諾看到老仇人就在眼前，恨不得立馬讓他腦袋開花。泰科斯說這就是革命的最好機會，隨後與雷諾一起攻向了旗艦，他們這對老搭檔默契絕佳，舉手投足間就能夠做出完美配合。不出片刻，雷諾便轟開了蒙斯克指揮室的大門，他叫蒙斯克把頭轉過來，要讓他死個明白。誰知道眼前這人並不是大帝，而是大帝的繼承人——維勒安王子，他說自己才是莫比斯基金會的真正主人，所以雷諾也要聽命於他。雷諾不吃這一套，質問他有什麼理由可以繼續活着，維勒安不慌不忙的解釋道：「因為我能提供給你一個拯救莎拉?凱莉根的機會。」他要把所有神器集合起來，然後建造一個可以讓凱莉根復原的儀器，他選上我們是因為——只有雷諾會不顧一切的去拯救莎拉。
麥特不希望與維勒安合作，泰科斯則認為這是個不錯的交易，雷諾讓他們別操之過急，時機還沒成熟。而麥特堅決反對這個計劃：「襲擊蟲族所在的查爾行星只會是個自殺任務，大家用命去拼，換來的只是你的女朋友而已。」雷諾解釋說這並不只是為了自己，而是為了所有人，刀鋒女皇對人類來說是個大威脅，帶回她就可以解救無數生靈。雷諾為此已經孤注一擲，不容任何人質疑。接下來維勒安王子發來了通訊，他想要討論一下關於查爾的遠征計劃，雷諾卻首先質問他這麼做的目的，原來他是想證明自己能成為比父王更好的君主，如果能與罪犯雷諾聯手並把刀鋒女皇變回人類，這將是最好的證明。
第二十三章：虛無之門
任務簡報：維勒安王子發來消息，莫比斯找到了最後一件神器，只要找回這件神器，就可以開始拯救凱莉根的計劃了。
新增單位：戰巡艦
主要目標一：占領着陸區
主要目標二：摧毀薩爾納加陳列室
可選目標：營救星靈囚徒
資金獎勵：125000
神族研發：+4
成就：
虛無之門：在達成所有任務目標的情況下完成任務《虛無之門》
力量與我同在：在普通難度的任務中摧毀所有撕裂力場產生裝置
宇宙法則大師：再不讓任何單位死於撕裂立場的情況下完成困難難度的任務
維勒安給我們明確了最後一件神器的下落，在一艘被遺棄的薩爾納加飛船上，這艘船配備着撕裂力場發生裝置，可以在瞬間粉碎任何物體。幸運的是，王子會把牛頭人級戰巡艦提供給我們，強大的艦隊應該能夠抵抗住撕裂力場。另外值得注意的是，這里仍然有塔達力姆的存在。真是一個非常危險的任務，泰科斯似乎不太情願，他好不容易從監獄逃出來，不想白白浪費餘生。雷諾表示理解，他讓泰科斯這次好好休息一下。
戰巡艦首先得幫我們清出一個着陸區，它們動用大和炮轟掉了這里的力場發生器。基地架起後，雷諾讓我們多召集幾艘戰巡艦，爭取一次突破重圍，維勒安也很贊同這個戰術。礦區的資源很少，麥特說這里由於長年受到隕石撞擊，或許能在四周發現一些散落的礦物。我們奉命出去探查，除了礦物之外，周圍還有一些塔達力姆士兵，為了避免受到他們打擾，我們叫戰巡艦出來解決了問題。片刻後我們回到基地，收獲頗豐，但礦區的資源快要采盡了。副官建議把基地遷移到西面的礦區，但那里有一個塔達力姆據點，還有另一個力場發生器，我們只得先派艦隊過去掃盪一番。登陸到新據點時，附近的監獄傳來求救聲，是一些反對塔達力姆的黑暗聖堂武士，他們願意與我們一起並肩作戰。
當艦隊掃平又一個塔達力姆據點時，神器已經近在咫尺了。但塔達力姆顯然不想讓我們拿走這最後一個神器，他們的執行官駕着一艘聖母艦出現了，麥特提醒我們要特別小心它的強大能力。為此我們集結了一批頗為強大的空軍，其中不乏戰巡艦、維京、女妖等等。一切就緒，我們先讓空軍去摧毀周邊的力場發生器，然後再全力進攻神器的所在位置。聖母艦想來阻止我們，艦隊按之前的計劃分散開來，躲開了聖母艦釋放的黑洞，然後所有大和炮轟向聖母艦。打着打着的，聖母艦突然不見蹤影，一定是逃跑了。我們沒時間管它，艦隊繼續清理沿途的守衛。逼近神器時，聖母艦再次出現，這次不會讓你跑掉了。在我們的努力下，塔達力姆與他們的聖母艦全部被摧毀，最後一個神器到手了。
下一步計劃就是進攻查爾行星，但軍隊的士氣有點消沉，酒館里有一些老兄正在抱怨對雷諾的不滿，只有史汪還相信着指揮官。泰科斯聽到了談話，故意對他們說了幾句難聽的話。當他把史汪抓在手里時，雷諾出現了，泰科斯得理不饒人，把以前發生的糟糕事全部歸咎於雷諾一人，並且大打出手，雷諾知道這一戰終究不可避免，拿出矯捷的身手把老泰科斯好好教訓了一頓。後來他對大家宣言：「不論是對付自治聯盟，還是去查爾對付蟲族，一切全是為了拯救人類，如果蟲族把人類都消滅了，那麼擊垮自治聯盟還有什麼意義？」這才是大家一直所期盼的指揮官，兄弟們紛紛贊同，我們終於得到了一個滿意的答復。
第二十四章：地獄之門
任務簡報：所有的工作都已准備好，進攻查爾的計劃即將開始，這是一次無法回頭的行動，命運在等待着我們。
主要目標一：集結一支超過100人的大型部隊
主要目標二：消滅所有坑道蟲
成就：
地獄之門：在完成所有任務目標的情況下完成任務《地獄之門》
巨無霸加農炮：在普通難度的任務中摧毀所有孢子加農炮
自治聯盟大雜燴：在困難難度的任務中救回10個自治聯盟的空降艙
雷諾被請到了維勒安的旗艦上討論戰術，他們下方是一顆有如地獄般的行星——查爾。沃菲爾將軍是這次的戰術指揮官，不過雷諾無法認同他的策略，沃菲爾也不信任雷諾的力量。此時維勒安王子出來打了圓場，隨後與蒙斯克進行了通訊。維勒安正在向蒙斯克說明這次進攻查爾的計劃，大帝不太看好他，此時雷諾插了進來：「他並非一個人，還有我！」通訊結束後，沃菲爾發現蟲族正席捲而來，沒想到來得這麼快，他只能稍作布置。雷諾指揮官也要回海伯利昂號備戰了，地面上再見吧。
總攻已經開始，雷諾與泰科斯正在查爾的某處，他們查看了盟軍的情況，簡直一團亂。正面攻擊對蟲族是沒用的，只有少數隊伍可以成功逃到地面，但這只會造成四處分散。凱莉根突然出現在通訊屏上，她說這次將會讓我們全部感染，最後聽命於她。通訊結束後，雷諾立刻決定了初步作戰計劃：盡可能多的把生還者召集起來，組織一支真正的戰力。
行動開始，雷諾吩咐麥特要隨時報告盟軍的空投艙位置，以便於我們尋找。由於資源儲備已經齊全，基地里不需要再建造補給站了，這還真是方便。我們很快就訓練出一批部隊，還讓工程車做好了防禦工事，現在就等盟軍降落了。片刻後，麥特報告了基地附近一個空投艙的位置，我們得在蟲群吞噬他們之前趕過去。雖然指揮官是惡名昭彰的罪犯雷諾，但自治聯盟的士兵別無選擇。後來我們又營救了降落在各處的盟軍，軍隊陣容也隨之逐漸壯大，周圍的蟲子都被我們清掃干淨了。此時，沃菲爾將軍發出了求救訊號，他的戰艦被蟲族擊落了，只有少量部隊還在墜落處苦撐。沃菲爾所在的位置全是地下蠕蟲，一定要救他出來，我們為此動用了所有部隊。在這期間，聯盟的空投艙已經全部抵達，有的成功，有的失敗，剩下就只能靠我們自己了。
沃菲爾那邊的情況非常不妙，蟲群不斷地沖上來，部隊士氣直線下降，最後只剩下他一個人。他拼上了老命，直至打完最後一顆子彈，終於被幾頭刺蛇牢牢圍住。關鍵時刻，我們的英雄雷諾及時登場，打爆了刺蛇們的腦袋，泰科斯也隨後趕到。剛喘了口氣，蟲族再次大量涌來，雷諾告訴沃菲爾不用擔心，然後令女妖戰機開始轟炸。幾分鍾後，蟲群終於被掃平了，沃菲爾對於這次營救非常感激，他完全沒有想到會是雷諾指揮官出現在這里。
第二十五章：深入虎穴
任務簡報：在大家的努力下，降落區域安全了。沃菲爾認為當下不能直接進攻主蟲巢，而是應該先以牽制性攻擊來癱瘓蟲族的部分防禦。
泰科斯對於破壞蟲族防禦有一個想法，他認為應該先幹掉地下蠕蟲，因為它們完全可能出現在任何地方。雷諾想的也一樣，只要炸掉蟲殖地網中的正確節點，就能讓里面灌滿岩漿。可沃菲爾覺得這個計劃很危險，他說蟲族的空軍才是大麻煩，會不斷干擾我軍的空中掩護。他提出一個建議，只要攻下那個被蟲族感染的低軌道平台，我軍就能取得制空權。地面轟炸不會起作用，必須派突擊隊去平台上摧毀所有蟲巢。這是個艱難的決定，兩種行動都能帶來巨大優勢，但我們所剩時間不多了，只能由雷諾來選擇其中一種行動。
選擇之一：破壞地道
主要目標：炸毀地道中的每個斷層
任務獎勵：地下蠕蟲不會出現在最終章
成就：
深入虎穴：在達成所有任務目標的情況下完成任務《深入虎穴》
鋼鐵意志：在不讓任何英雄失去意識的情況下完成普通難度的任務
一發五十殺：在困難難度的任務中讓雷諾以單發狙擊的方式擊殺50個單位
思考片刻，雷諾覺得還是應該優先炸掉蟲殖地網，因為地下蠕蟲會對整個基地造成威脅。雖然與沃菲爾將軍的評估不同，但他仍然遵守了命令。副官對蟲殖地網深度掃描後，探測到3個斷層，這就是雷諾所說的正確節點了。比較令人擔心的是地下的怪物們，由於岩石層太厚，副官無法偵測出蟲族的具體訊號。雷諾對蟲族地道有經驗，人越多隻會越危險，最好是由少數精英合作行動。沃菲爾向他推薦了一些身經百戰的老兵，但雷諾覺得還是帶自己的人馬較好。地道中有一些降落時逃進來的小隊，當偵測到他們的訊號時，沃菲爾會把具體坐標發過來，為我方增加一些戰力。
雷諾挑了3個夥伴與他同行，分別是泰科斯、史汪、斯特曼，他們都是我軍精銳中的精銳。進入地道後，雷諾一來就使用了威力巨大的MK-XII穿甲彈，瞬間穿透了一整排蟲族。泰科斯不想看到雷諾一個人耍威風，掏出了平常都捨不得用的撕毀者手榴彈，只需一顆就能炸飛一群蟲子。隨着他們逐漸深入蟲穴，雷諾的移動感測器反應越來越強烈，來到一個路口時，感測器居然破表了，雷諾趕緊讓史汪架起剛帶來的炮塔，史汪管這個叫「火焰貝蒂」，除了吐出烈焰外，它還能吸引蟲族的攻擊。燒烤遊戲結束，小隊繼續深入洞穴，走了片刻，沃菲爾發來通知，他探測到一隊避難士兵正被牽制在附近，希望雷諾能解救他們。增加一些戰力也不錯，雷諾率小隊向着沃菲爾發出的坐標走去。路上遇到一些麻煩，一隻變異體什麼的，不過他們順利找到了沃菲爾的人。距第一處斷層已經越來越近了，蟲族派出了好幾條地下蠕蟲，可卻無濟於事，史汪成功把核彈安在了斷層上。接下來是緊張刺激的防守時間，蟲群不斷從四面八方襲來，小隊使出了渾身解數，所幸火焰貝蒂幫了不少忙，一直撐到核彈快爆炸時，他們才逃進一旁的洞穴。隨着一聲巨響，斷層被炸開，岩漿猛烈地迸發了出來。這只是第一個斷層，等三個斷層都被炸掉後，岩漿會把這里全淹沒。
小隊繼續向着第二個斷層進軍，他們在洞穴里發現很多受感染的人類，這一定是蟲族關犯人的地方，雷諾讓小隊終結了這些感染者的痛苦。可他們前進的路上一直有更多的感染者聚集在一起，泰科斯受不了這麼多張醜陋的嘴臉，扔出了好幾顆超級手榴彈，他替小隊除掉了不少麻煩。來到一個狹窄的通道時，雷諾發現了毒爆蟲，必須在它們靠近前解決，不然會被劇毒噴到。剛從通道出來，沃菲爾就發來了另一隊避難士兵的坐標。幹掉一隻地下蠕蟲後，小隊又有新兵加入了，剛加入的火焰兵說要小心前方洞穴的一大群蟲子。來到洞穴前，感測器何止掃描到一大群，簡直是成千上萬只蟲子，而且還源源不絕的向小隊覆蓋過來。固守在一個位置是行不通的，雷諾令小隊頂住蟲群，不斷突進。經過一番苦戰後，他們終於殺出了重圍，斷層也隨之出現在眼前。像上次一樣，小隊設置了一道防線，防止任何蟲子接近核彈。戰鬥中，泰科斯發覺好象有地震，雷諾告訴他那是雷獸，泰科斯鬆了口氣，對於他來說，雷獸要來得比地震可愛多了。
只剩最後一個斷層了，雷諾探測到前方有一些頻率穩定的訊號，很可能是蟲卵或幼蟲。當他們來到這個孵化區時，所有蟲卵一下全部孵開，就好象在等着他們一樣，斯特曼說這也許是被某個蟲族生物所控制的。之後沃菲爾又發來一隊避難士兵的坐標，聽起來處境很危險。來到沃菲爾標記的洞穴後，他們看到避難士兵正被一頭龐然大物所困，是末日獸！外型雖然與雷獸差不多，卻更厲害十倍！末日獸似乎太專心於眼前的大餐，對背後來的小隊完全不加理睬，雷諾他們憤怒的砸上了所有技能，只見末日獸死得非常慘。終於到最後一個斷層了，史汪設置核彈時，一隻蟲後突然出現在附近蟲卵區，它想要孵化所有的蟲卵。雷諾命令大家盡快打倒它，不然會威脅到核彈。但蟲後不止能孵化蟲卵，它本身的戰鬥力也非常驚人，受傷後還會鑽地躲避。經過幾番苦戰，小隊終於打倒了它，核彈同時也進入了倒數計時。史汪丟下一個火焰貝蒂來爭取時間，小隊趁機跑出了爆炸范圍。當最後一個斷層被炸掉後，熔岩開始上升，雷諾他們必須趕在被淹沒之前到達撤離點。
被岩漿追着跑的滋味不是很好受，雷諾帶小隊奮力逃出了地道，隊員們都很享受這次燒烤大餐。但當他們回到營地時，映入眼簾的全是盟軍的屍體，這里被蟲族突襲了！一架運輸機忽然從天而降，沃菲爾走了下來，他的右臂被換成了機械手，不過他還活着。運輸機還帶來了另一樣禮物，那就是組合完畢的神器，只希望它能發揮出預想中的效果。雷諾隨後在營地發表了一段鼓舞人心的講話，所有戰士都通過收音機聽到了這段發言，大家的士氣為之大振。
選擇之二：攻擊平台
主要目標：摧毀所有冷卻塔
可選目標：消滅異蟲利維坦
任務獎勵：飛龍與寄生王蟲不會出現在最終章
成就：
撼動天空：在達成所有任務目標的情況下完成任務《撼動天空》
破壞王：在不讓任何單位死於平台爆炸的情況下完成普通難度的任務
快去快回：在25分鍾之內完成困難難度的任務
經過深思熟慮，雷諾還是覺得空中掩護比較重要，地下蠕蟲只管在它冒出來時再解決就好了。接下來是作戰討論時間，蟲族的空軍把老舊的星際軌道平台占據為它們的作戰基地，並且蛀巢很深，很難用炮彈炸毀，但如果派地面部隊去清除的話又會付出昂貴代價。雷諾有一個法子，他讓副官去調查平台的動力來自何處，得出的結果是核反應爐，而反應爐會產生很高的溫度，有一連串冷卻塔在給它降溫。這就是雷諾想聽的，他決定讓我們去摧毀每一個冷卻塔，迫使反應爐變得不穩定，從而幫我們解決掉這個平台。
麥特掃描到了所有冷卻塔的坐標，我們正在訓練一支強大的軍隊來摧毀這些塔。蟲族察覺到了我們這群不速之客，過來騷擾了一下基地的防禦工事。既然被發現了，我們也不必再躲藏，部隊直接南下踏平了一個孵化所。然後輪到附近的冷卻塔，這里的防守兵力較多，再加上個不時會冒出飛龍的隧道口，要拆這個塔還真費不少事。沒了冷卻塔後，反應爐的溫度急劇上升，雷諾讓大家趕緊離開這，否則會被爆炸波及。我們順便回基地補充了兵力，然後撕碎了西面的蟲族孵化所，相同方向正好還有另一個冷卻塔，麥特提醒我們：「那邊的地面防守很森嚴。」激戰過後，我們摧毀了這邊的冷卻塔，正當大家在欣賞煙火時，沃菲爾卻突然叫我們看另一個東西。哇！這是什麼？從來沒見過的空中巨怪，重點是它居然在朝我們的方向飛來。雷諾讓我們提高警惕，以最快的速度幹掉它，否則可能會造成巨大傷亡，雖然我們也這麼想，但開戰時根本不是那麼回事。後來聽說這怪物被稱作利維坦，它那恐怖的觸手以及從體內不斷噴出的暴戾蟲，不知道殺死了我們多少弟兄，最後艦隊動用了所有大和炮才把它打爆，絕對是一場可怕的回憶。
經過剛才那場恐怖的戰鬥，兄弟們的士氣意外地高漲，連那麼厲害的怪物都被我們打倒了，後面還有什麼可怕的，大家堅定着必勝的信念，邁步挺進了其餘平台。行動非常順利，蟲族的爪牙沒能阻止我們炸掉整個平台，大夥都高興地坐上了戰艦。我們終於凱旋歸來，可是卻沒人出來歡迎，走進營地一看，盟軍全都死了，難道是遭受襲擊了麼？沃菲爾將軍也不見人影，真擔心啊。片刻後，一架運輸機從天而降，是沃菲爾，原來他沒死，只是失去了一條右臂。將軍帶來了組合完畢的神器，不知它的效果有沒有預想中那麼厲害。一番交談後，雷諾指揮官發表了一段鼓舞人心的講話，整個查爾的戰士們都從收音機上聽到了，這是為最後勝利發出的宣言。
最終章：背水一戰
任務簡報：維勒安王子對雷諾的實力很有自信，他相信我們一定能夠用神器打敗刀鋒女皇，結束掉這場殺戮。
主要目標：
成就：
背水一戰：在達成所有任務目標的情況下完成任務《背水一戰》
扭轉乾坤：在以神器擊殺150隻蟲族單位的情況下完成普通難度的任務
王牌軍團：在困難難度的任務中只使用過一次神器
沃菲爾將軍已經讓工程隊把神器搬去了主蟲巢附近，為了鞏固最後防線，基地四周都挖起了壕溝。我們必須守護神器直到它充能完畢，這樣才能給刀鋒女皇造成致命一擊。充能期間蟲族會受到神器的脈沖放射波吸引，這會讓它們不顧一切沖過來。雷諾擔心我軍所剩的戰力不足以抵擋那麼多蟲族，沃菲爾給他出了個主意：「根據提示，神器可以釋放一種被稱為能量新星的大范圍殺傷能力，不過無法頻繁使用，所幸這個能力並不會傷到我們，因為它發出的是亞音速頻率。」雖然有這麼厲害的寶貝，但一想到凱莉根正埋伏在某處，雷諾還是無法放鬆下來。
進入營地後，第一個傳進我們腦海的聲音竟來自刀鋒女皇，她看到咱們把神器送到了門前，簡直樂壞了。蟲群立馬以迅雷之勢沖了過來，部隊才剛登陸，根本沒准備好，我們只得啟動了神器。一道刺眼的藍光瞬間迸發出來，伴隨着蟲群的一聲聲慘加，等我們睜開眼，四周就只剩下灰燼了。真是了不起的能力，連刀鋒女皇都忍不住夸贊，但她的部隊是無止盡的，不知大夥能不能撐到最後。
麥特說蟲群很快就會再度襲來，我們必須趕快把防線鞏固好。由於蟲族的空軍平台已經被炸掉，所以這次任務不用擔心空中怪物了，只需固守住神器兩側的路口就好。我們讓工程車在路口建了幾個碉堡，然後又調來了幾輛坦克，他們的攻城模式應該能夠阻止蟲群。剛忙了一會，就聽到遠處有騷動聲，蟲群又來了！不過我們這次做了充分准備，擊退它們應該沒問題。好不容易擋住一波襲擊後，地下蠕蟲在基地那邊冒了出來，兄弟們急忙回去防守，可剛殺死地下蠕蟲，路口那邊又告急了，等我們趕到，一個碉堡已經被毀。經過一番苦戰，我們意識到這將會是史上最嚴酷的防守戰，如果再這樣下去，防線遲早會被突破。反正是最後一戰了，不如狠狠心，把資金全部砸上。決定下來後，我們大量引進了攻城坦克，也增加了路口那邊的碉堡數量，就連基地內都建有碉堡，目的就是為了抵禦地下蠕蟲，免得兄弟們來回奔波。最重要的是，我們架起了斯特曼的頂級發明——幽能幹擾器，在這玩意面前，蟲群只會像蝸牛一般慢，下了如此重金，我們絕不讓蟲族再越雷池一步。結果就如預期一樣，防線外堆滿了蟲族的屍體，地下蠕蟲對基地的襲擊也從沒成功過，看到這情景，凱莉根決定親自出馬。但盡管她再怎麼厲害，雙拳始終難敵萬手，一輪激戰後她被迫鑽進了地底。我們竟然逼退了刀鋒女皇？這簡直是一個創舉！正當我們高興時，遠處再次傳來騷動，放眼望去，只見黑壓壓的一大片蟲子，雷獸首當其沖，它們身後是無數的跳蟲與刺蛇，這次來的數量比以往多出幾倍，看來凱莉根真的生氣了。就算我們擁有如此森嚴的防備，但要對付那麼大的數量，損失不可避免。此時麥特提醒大家，能量新星應該准備好了，我們奉命再次啟動神器，一圈藍色火焰瞬間向外噴發，四周隨之安靜下來。在好幾波的猛攻都以失敗告終後，凱莉根又沉不住氣了，她以完好的狀態再次出現在我們眼前，可是她大概忘了上次的教訓，最後又狼狽而逃。不知過了多少時間，我們終於等到了期盼已久的消息：神器的充能就要完成了！同一時間，傳來一個陌生女人的聲音：「不要放棄！」雷諾說這是莎拉的聲音，莎拉不就是凱莉根麼？泰科斯說刀鋒女皇已經失去控制了，那是她人類時的人格。此時神器能量已達最大值，沃菲爾將軍啟動了神器的終極能量新星，威力幾乎於之前的十倍，范圍更是覆蓋整個主蟲巢。轉眼間，已看不到任何蟲族的蹤跡，耳根也得以清淨，我們成功了！！
根據維勒安的說法，神器的力量可以使刀鋒女皇變回人類，雷諾滿心期待地奔向了主蟲巢，為了以防萬一，我們緊跟在他後面。這里到處彌漫着惡臭，神焰燃出的灰燼遍布四周，但卻看不到凱莉根的身影。我們跟着雷諾走進一個巢穴，遠處好象有東西，順着槍燈的光線望去，隱約看見一隻手。走近一看，原來是個赤身的女人，雷諾蹲下抱住她，口中呼出她的名字——莎拉。看樣子維勒安沒有撒謊，雷諾長官的愛人又回來了。可泰科斯突然把槍對准莎拉，他說自己與魔鬼定下了契約，用凱莉根的死可以換回他的自由。雷諾明白泰科斯的選擇，但他不會允許別人殺掉自己的女友，更不會允許澤拉圖的預言成真。他算準了泰科斯開槍的時機，迅速用肩甲擋住子彈，然後轉身幹掉了他的老搭檔，沒想到泰科斯的結局會是這樣。最後，雷諾抱着歸來的愛人離去，夕陽中只留下他遠去的背影。
來源：遊民星空
