長話短說，細節之後補充。
個人支持接近beam被激光掃到之後都是indoctrination的過程, 證據如下：
1.除了SHEPARD 之外，沒有人見過小男孩。第一次出現時ANDERSON完全無視小男孩讓SHEPARD繼續前進，注意聽這時REAPER發出了哀嚎，在ME的小說的第三本里提到過，這種哀嚎是INDOCTRINATION中斷的標志之一。而當小男孩上運兵船時，沒人甚至拉他一下。大家都沒有看到他。
2.結局選項里有一項就是synthesis（融合），遊戲對Saren的描述有一句：「It made Saren believe synthesis would save the galaxy。」 耳熟麼？
3.當你選擇control或者synthesis的時候，注意SHEPARD的眼睛會變成藍色，這和SAREN以及ILLUSIVE MAN一樣。這時INDOCTRINATION完成的標志之一。
以下是幻覺的證據：
4.SHEPARD被激光擊中後，昏迷中聽到了聯邦要求大家撤退的聲音，但是他醒來之後，前方基本已沒敵人，發射紅色激光的母艦HARBINGER已經不在了。為什麼在這種安全的情況聯邦不前進反而撤退，這里只能解釋為所謂的「醒來」是SHEPARD自己的幻覺。
5.SHERPARD醒來之後周圍出現了一些灌木和樹木，注意這些植物在沖鋒的時候是沒有的。但你覺得眼熟？沒錯，因為他們都出現過在SHEPARD的夢境中。
6.在SHERPARD被白光吸上去後，所有的場景都是由收割者飛船，DARK BROKER飛船以及一代最終場景排列組合而成的。這時HARBINGER利用SHERPARD的記憶創建的空間。（參見電影《生死停留》），而電影《盜夢空間》里也提出過類似的理論。
以下是進入操控台之後的分析：
1.ANDERSON代表的是SHEPARD的自我意識，ILUSSIVE MAN代表的是SHEPARD已經被INDOCTRINATE的那部分意識。這兩人此時不存在，只是意識的形象化而已。可以說此時在INDOCTRINATION的作用下，SHEPARD是處於一種人格分裂的狀態。
2.滿臉是血的SHEPARD舉着槍跟自己的意識對話，像極了《搏擊俱樂部》的最後一幕。
3.SHEPARD朝ANDERSON開了槍，ANDERSON用左手去捂傷口。後來我們卻看到，沾滿鮮血的是SHEPARD自己的左手。這像極了《黑天鵝》刺腹的那一幕，以為刺死了對方，卻發現受傷的是自己。
4.（可選）如果SHEPARD讓ILUSSIVE MAN殺死了ANDERSON代表了被征服的意識戰勝了本源意識，結局是SHEPARD死亡，人類毀滅。
5.ILUSSIVE MAN極力否認自己被控制，並且開槍自殺（可選），這兩點和SAREN簡直是一模一樣。而不管是他自殺還是被SHEPARD殺死，接下來便是小男孩的出現，這便是計中計的開始。
6.ILUSSIVE MAN要SHEPARD去「控制」，小男孩讓SHEPARD去「融合」，說法不同，本質都是讓SHEPARD放棄自己的本意（即ANDERSON說的去「摧毀」），這兩種說法是連環套，計中計，指望讓SHEPARD（或者更應該讓說玩家）中計上套，去相信不摧毀才是正確的。發現了麼？這個遊戲的有趣之處在於，他不是讓SHAPERD面對這個問題，它把你拉入了遊戲，現在是你跟機器的鬥智，去思考去判斷。什麼叫角色扮演？！
7.我們看出INDOCTRINATION不是改變你的意志，而是騙取你的信任。你最終被控制，是因為你發自內心的相信那個騙局。在藍色和綠色的結局里，那些結果不是真正的結果，是你被中計被欺騙後「相信」的結果。這樣的結果被相信，表明了INDOCTRINATION的徹底完成。而SHEPARD本人，因此或者死亡了，或者變成了SAREN一樣的傀儡，不得而知。
8 只有打破迷局選擇了「摧毀」，才會在結局中看到SHEPARD在砂礫中的肩膀突然一醒，而結局在結尾字幕後出現了觀星者父子的對話，而最後一段是：「Can you tell me more about Shepard?” “Its getting late, but ok, one more story.” 請注意這句話，結合ME官網與玩家的對話，玩家問有沒有HAPPY ENDING. 官網答：「Theres no happy ending, because its not ended!” 為什麼its not ended呢？ 因為one more story。one more story在哪里呢？也說了, “its getting late” (DLC).無數線索表明，砂礫中醒來的SHEPARD只是在昏迷中戰勝了INDOCTRINATION,真正的決戰，亦即摧毀REAPER的過程，在醒來後開始。
關於觀星者，我比較相信最終SHEPARD 不管成功與否，人類是否毀滅。諾曼底的逃脫是絕對的事實。而觀星者我相信是諾曼底上的成員。所在的星球即是當時墜毀的星球。
讓我們期待本來就在計畫之中的EXTEND CUT吧。BIOWARE你贏了。。。。
PS:其實我最後也猶豫了，但最終選擇了紅色結局，不是因為我想通了，而是因為……玩了快五年了，一直被REAPER折磨，一直想殺之而後快，我特麼才不管人類幸不幸福，我特麼才不管下一次會不會又輪回，我特麼先弄死你再說。。。。。
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來源：遊民星空
